EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-13955 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr3:662436-663075 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr3:662566-662580TGATGACGTCAGCT-6.31
BATF3MA0835.1chr3:662566-662580TGATGACGTCAGCT+6.57
ELK3MA0759.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
ETS2MA1484.1chr3:662871-662881ACTTCCGGTC-6.02
ETV1MA0761.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
ETV4MA0764.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr3:662919-662932GATTAATTAATGT-6.03
POU1F1MA0784.1chr3:662963-662977AATATGCTAATGAT+6.58
POU3F2MA0787.1chr3:662964-662976ATATGCTAATGA+6.27
POU3F3MA0788.1chr3:662963-662976AATATGCTAATGA+6.11
POU4F1MA0790.1chr3:662917-662931ATGATTAATTAATG+6.04
POU6F1MA0628.1chr3:662920-662930ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:662920-662930ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AATTCAAGTA AATGTATTAT TTACTTGATT TTCTTTCATA TAAAGCTAAA TCTTTCGAGC 60
GTTTAATTCC TCTCGTTAAT ATTAAATCTA TTTCAAAAAG CCTAAAACTA GCGCGGTGTT 120
TATGACGCGC TGATGACGTC AGCTCGCGTG CGTCCTCCCC TCAAATCGCT CCGTGCGGAA 180
ACTGGCGGCG CGCGCGTGGC ACGAGCGACC GGAGGAACAG ACACAGATCA GACGCGCCGC 240
TGCGCTCCGG TGTGTTGAAT GAATAAATAA ACCCTCGACG CGTTTACCGA TGACCGCGAG 300
CACTGCACGG TGAAGGTGAG CAACCGAGGA TTTAGATCCG CATCACACAC ATACACACAC 360
ACACACCGCT GCAACATCTG CACTGCTCGA GATTATACTG ATCATCATAA TAATCCGGTG 420
TCGTGAGTGA GGGGTACTTC CGGTCACCGA TAATCTCAGA GCAGTGCTAG CGTTAGTAAT 480
GATGATTAAT TAATGTACTA TAGTAGAGCA CACAGCTGCT GGTGATAAAT ATGCTAATGA 540
TGTGGTTTCC TGATGCCTGC ATCATCTCTC CGGAACCCTT CTGCTCTGGA TATTAGTATG 600
CTGATGTGTG GAGGACCCGA GCTCTGACCT GGTTTATCA 639