EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-13893 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr25:34541671-34542994 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr25:34542416-34542427GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr25:34542416-34542427GTTTTATTGCC-6.62
FOXF2MA0030.1chr25:34541846-34541860AATGTTTACCTTTA-6.27
HOXD9MA0913.2chr25:34542416-34542426GTTTTATTGC-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr25:34541717-34541730ATTAAGTGTTTAA-6.19
Enhancer Sequence
TTAATTAGTC ATTTGGGCTG ATCATACATA ATATAATTAT GAAAAAATTA AGTGTTTAAA 60
AAATATGAAA TTTTAAGTCT AACATAAAAC TGAACTGTAA ATTTAATTCT GTACAGTTGA 120
GGTCAAACAA ATCCAAAAAC AAGATTAAAA TCTTGTAATT ATTTAAATTT GAGTCAATGT 180
TTACCTTTAT TTAAAAAAGT CTATTTAAGC ATTGAAATAA CAATAAATAC ATATTAAAGA 240
AGAATAAAAT TAACCGTTTA TTAAAAGAGG AAGCTTAAAT CAATGACACG TTTCATACAA 300
TAAATTGTCA TTCAAAAATA TATTAATTGC TAAGCATGCA CATTTGTGTG ATGAATATAA 360
AATTATTTTG CAAACAGTTG TATAGTTGAG GTAACCTAAA TCATTCATAA AATCACCCAC 420
ACATACAAAA CCTTTTTAAA ATTACTCCAG TTTATGAATT GGGATTGAAG AGAAGATTGA 480
CCACCTTTAA TTTTGAAAAG ATACATAAAA AGCTTTGTTA CTCGATTTAT TGAAATTAAA 540
GGAGATAAGC GCATCATCTT TTCCTATTAA TCTTTTTTAA CTATTAGTAT CATAAATCGT 600
TTAGTCTCTA CATTGCAAAC TTAACTCATA ATAGTTTTAA TTGTTATAAC TCCAGTTGAT 660
CTAAATGTTT TCTCAACTAA CCAAATCCAA CATTGTATTT TGAAAACAAA TCATAATAGC 720
TTTCATTATC ATATTAAATT TGTATGTTTT ATTGCCCTTT AAAGAACAAG TGGGTGGCTC 780
TTAAAAGAGC CTTTGGGGAA ATACAAAATG GAAATCAAGC TAATTTATTT GCCTTTGGCG 840
GCCTTCTCGG TTTTCTTGGG CAGCAGCACG GCCTGGATGT TGGGCAGCAC ACCGCCCTGA 900
GCGATGGTCA CTCCGCCCAG AAGCTTGTTC AGCTCCTCGT CATTGCGTAC CGCCAGCTGC 960
AGGTGACGGG GGATGATACG GGTCTTCTTG TTGTCCCGAG CGGCGTTTCC AGCCAACTCA 1020
AGGATCTCAG CGGTCAGATA CTCGAGCACA GCGGCCAAGT AGACTGGAGC ACCGGCACCA 1080
ACACGCTGAG CATAGTTACC CTTGCGGAGA AGCCTGTGAA CACGGCCAAC GGGAAACTGA 1140
AGTCCTGCCC TGGAGGAGCG ACTCTTAGCC TTCGCTCTGG CTTTTCCGCC GGTTTTGCCT 1200
CTTCCGCTCA TGTTGCTCAG ACAGTTCTCA AAGACTACGA TGTTCTGAAG CTCGACAATC 1260
AGCTTTTAAA GCTAACGTAC TTCCCGCCTA TTGATCAGAA TCTCTATCAG TTGAAAACCA 1320
ATC 1323