EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-13798 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr25:28609486-28611122 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr25:28610249-28610264ACCTAAACAAACAAA+6.31
RORA(var.2)MA0072.1chr25:28610163-28610177AAAATGTAGGTCAA+6.57
ZNF263MA0528.1chr25:28610929-28610950GGGGAAGGGGGATGGAGAAGA+6
Enhancer Sequence
GAAAACAATA TTTTTTGCGC ACAGTTCCCA ATAAAATAAA ATAAAATAAA TGAATAAATA 60
AATATTTCAG GTGACTAAAG ATGAATCATT TTAACTATTT CCATGTTTTG GAATTAATCT 120
GGGATAAACA AACATGGGTG AAACCTACAG CATGAGTCTA CCAGATAAGC TAGAATAACC 180
ACCAAAATGA TAGCCAATGT GAATACAGTG CACCATTCAG AAACCCGGCA TTAAGTCAAC 240
AGGCAGTAAT ACTCAAGATG GGTTTCCCGA AGTGCTATCG ACACCTAGTT GGGATTGTTC 300
AACCGAGATG AAACAGTAAC CCTCTCCTAT CAAGCAGACC TCTCTGGGTG TTAATGCAAA 360
TACAGCAGTA TGCTGATAGG AATGGGTGGT AATTGCATTT TGATAAGTTA GGGATCATGC 420
TGTGTGGGAG GGTTTTGTCT TTTGCCCTCA CCTTGAGTCA ACATTTAGTT CAGGCACTGA 480
AGCTATTTTA TATATTCTAT CAAGCATTTT TACAGTAGGG TTGGGCGGTG GAGATTATGC 540
TGTATATACA TGGTAAAAAT ATGAGACACT AAAAACTAAC ATACAGCCTG CTAGTCTAAC 600
TATGCACTTC CATTGTAGAT GGCTTTGTTG ATCATAACTG GGGCAAATTG GCTTTGAAGT 660
GCGACATACA TCTAGTTAAA ATGTAGGTCA AGTCAGATTA CATAACACAA GCTCTGCGTG 720
GTTTAGTTTC CAAAATAATT AGTGTTTGAA AAAAAGTTAA AAGACCTAAA CAAACAAAAG 780
CTGAACCAAA ACACAAAAGA AAAGTAGACG TTTTGAAAAA ATAGCAAAGA CAAAAATGAA 840
GTGAAAGAGA CTCAGCTCAG ATATAAACAG GTTAAAACAC AGGTTAAAAA CAAACAAAAC 900
ATCAAGACAA AAATAACAGT TCCCAAAATA AATGAATAAA TCAAAATACA CAAAGAAAAA 960
AAGATTCCTG AAAAAACAAA CAAATAAAAA GTATACAAAC TGACTTTAAA AAAAACAACA 1020
ACAAATAAAT AGAATTTTAC TAAATAACAA AAACAACAAA TAAAGCTTGT GTTCTTCAAA 1080
TAATTTTTTC GAGAAGCAAA TAAAAAAATA AAAGATGATT TTTTCTGCAT AAATTACTAC 1140
TATTTAACTA CAGTGCAACA ATTAAGCTTC TTTACATTAA TGATATCAAA TACAAACTAA 1200
GACCGCCCAA GAAAACTTTC CTTGACTGGG ACGAGAAAAC GTATGTCCAA GCGTCATACG 1260
GCCATTCGAT TTTTAAGAAT GTCGCAGCTG CTCCATGGGC ACAAGCAGTG GACTGCACCA 1320
TGGGGGACTG CCTGGATCTT TAATCCAAAT CAAATAATTG GGTCCCCGCT GCCAAAAGTC 1380
ACAGTATCAC TTATTCGGCT CCTTGCTGTG CAAGAAGCAA TAAAGACTGT AGTGACGGTG 1440
GGAGGGGAAG GGGGATGGAG AAGATCGGGT ACTTTTATCC CTGGGAATTT GTAATGGATC 1500
CATTAAGAGC AATTGGTGGC TAGATGCTGA ACTACTTTAA GTGATATTTT AAGGTGTGCG 1560
GTTATCCCAC AGTAAGACAA CATGGGAAAT CCATTGTGGG GGGAAAAAAA CTGTCTTGCA 1620
AAATGTGCAC AATTGT 1636