EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-13598 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr25:16549729-16550584 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr25:16550483-16550495AATCGTTACATT+6.32
Foxd3MA0041.1chr25:16550292-16550304GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxj3MA0851.1chr25:16550376-16550393GTCTTTGTTTACAATCC-6.21
Enhancer Sequence
TATCGCCCTG CCCATCTGTT CTTCTCCTGT GAAATGCGGA TTGAAACAGA TTGAACGATT 60
CTACGGGTCG CGATGGCTAC TGCGCCGCAA GGACAACAAG TTTTGCTGTT CAGTTAAACA 120
AGTTCTATGT AAGGGAAAAG CCGGACGGAT TCGTCTAAGA CACACTTTTT AATGTAAGAC 180
ACGCGTTGGA TAACAGGAAA ATGTCCCAGG GATGTATAAC TTCAGCGGAG GAGATCCAGT 240
CTTGGTGGGA AGTCCCCGCC ATAGCGCACT TCTGCTCTCT CTTCAGGACG GCGTTCAATT 300
TACCAGACTT TGAAATCGAG GTAAATGATC AAAGCTGAAT GGCCCTCCTT TCCTTTCCGC 360
CAGTCTCATT AAAACGAAAC TAAACAAACT CAAGTCCCCA CTCGACAGTG ATTGTGTGAT 420
AATCGATCAA TTTGTATATT AGTGTCTTAA TAAGACGTCA ACTTACATTA TGGTAAAAAG 480
TCGGTTATTC AGTGTTGGTT TATACAATAA CAGAACCAAG CCGTCCAACC AAACGTCTAA 540
GCAAAACATT TAACGTATCT GGTGTTTGTT TGTTTGATTA AATGTGTTTG TTTGAAAGGT 600
TTTATTGAAC GTAACTTCAT TTAAGTGATC AATAATGTTT TAGATTTGTC TTTGTTTACA 660
ATCCGTTGTG ACTTGGGTAA CTTACGTTAA GGGAGTAACA TTTAGTTTCG CCTTAAGCTT 720
AAATCCTGGA AATTAACGCT AACCTTACGC GTTAAATCGT TACATTGTTT GTATGTTTAT 780
CATCACATAT TCAATCTTGC AAGACCGGTT TTTATTTCTA GATTGACGTC GAACTGGCGT 840
CGAATGGGGT TTTAC 855