EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-13520 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr25:12713882-12714736 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXD2MA0847.2chr25:12714653-12714666CTAATGTAAACAA+6.11
LMX1BMA0703.2chr25:12713961-12713972GTTTTAATTAA+6.14
Nkx3-2MA0122.3chr25:12714718-12714731ATTAAGTGGTATT-6.05
SOX13MA1120.1chr25:12714002-12714013AGCCATTGTTT-6.14
Sox6MA0515.1chr25:12714004-12714014CCATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
ATTTAGCTGG TCATATTCCT GGCATATTCG ACCAGGTAAA ACCAGCATAG ACTGATTTAA 60
GCTGTTTTTT TTCAGCAGGG TTTTAATTAA TAATGTAAGT TTTTTTTCTG AGAAAACAAA 120
AGCCATTGTT TTTCAAAACT ATTTACCTTT ACTTTTAATG TCAACCTTTA AAAATGTCAA 180
GTGACTTACT GTTTCTGTAC TATAAAATGC ATTTCTTATA TGCCATTTTT AAGTATTGAT 240
GTAGCCAGAC AGGTAGCTTT ACTATTCACT GCACTAGTTA TTTACCTAGA CACTACATGA 300
AAAGTTAATT CTGGCATATT CGTTGAAATT ACCTCGCATC CTCGCTGCAA AATGACAGAC 360
ACGTTAGCAC TGGCATCCAA GACCATGACA ATATCGATTG CTATTAATAC TCAGTAATAA 420
TGCGCATTAA ACGGTCGCGT CGAAGGAATT TGTTGGCATA ACGAATATTA CAAAATTACA 480
ACTCGTAACG TACTGCAGAC AGTTTATCGT GTTATTTACA TTTTCTATAG AAAAACACTT 540
TATAGTTACG TCAAGCAGCA AAGAAATGTC TAGACCAAAG CAAACAATCA GTTGACCATC 600
GCCTCAAAAA CTGCCTGTGA AAACGTAAAT CCTGCCAACT AGGGAAAAGG TAAACGTGTC 660
ACGACGCATC TTGGATGAAC TCCGCTGACG ACAGAAACCA CGTGAACGGT GGACTCTGAA 720
ATGTACGTGA GTAATAACAA GTGAAAACAG AATGTTCTTA CGTCAAGCAT TCTAATGTAA 780
ACAACATGTA ATTAGGACGT TGTACTTACA TGAACACGTT TCTGTGGTAA ATACAGATTA 840
AGTGGTATTC GCTC 854