EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-13516 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr25:12420023-12421073 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr25:12421001-12421011GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr25:12421001-12421011GTCACGTGAC-6.02
MITFMA0620.2chr25:12420997-12421015TTATGTCACGTGACTCGC+6.35
MITFMA0620.2chr25:12420997-12421015TTATGTCACGTGACTCGC-6.35
Enhancer Sequence
CTTTGAGATT ACTGCCATTA TGCTCAATTA TTTTTTATAA CATACTAACC CACAAAACAA 60
ACCCCTTTAC CTTTGAAATA AAAAGAAATT CCCAATTTTT TTCTTTTATT TTTCATCTCT 120
TTTCACAGGA CTACAGGAGC ATGCTGCATC TCTGTAAAGT AATGCTGCCA TTTGATATTA 180
ATTGAAGATT TTAATTTGAT CATTTTAGTG TAATAAAAAA TAAAACGAAT AAAGTGAAAG 240
AAAAATAATA AAATGAAATA AATACTTAAC GAAATGAACT GACAAAATGC TTCATATTAG 300
TCTAAAAGAT CGTGTAGTTG AACATGACTA GTTGACTTTT TTGTTAGATA AAGTAAAGTC 360
AGAACACATG TTTTATTATT TTAGTAAATA TGTATTTATT TATTTTGCAC TTTAAGTGTG 420
TTTGGCTGTA AACAGGCGCA GGTCAGATTT TCTCCAGGTC ATATATTACA ATTTAATTCA 480
TTTTGTGTAA AACAAAATAA TACATTAATT AGACCTGTCC AGTGTCGTTT GGAGTGTGTC 540
GGATTAATAT CAGATCAGAA TAAAACGAAT GAAGTGAGCA GGTGTAAACA GCCTCAAAAC 600
ATTGGACGGG ATTAGCGCAT TCTCCGGTCG TAAAGCCTTT ATCGGACAGT TATTTTCAAA 660
AATTGTTATG GCACAAGTCA AAAAATAAAA AGGTAAAGGG AGGTCGTGTA CGAGACAAAT 720
CAACAATGTC CAAATGGACG ACCCGGCTAA TGCGGCCAGC CTATAACCTG ATAGGGACAG 780
ATTCTCATCT GTAAGGAAGT AACGTCAGTC TTACCCTGTT TGCCAGTCTT TTTGTACATA 840
TGTTCAATAT TTTGCGACAA TGACGCTGTT GCCTGCTTTC TCTTCGTCTC TCTTGCTCTT 900
TTCGACCCAT TATAACGTTA TTCACTATGG ATGTCGCATC AAAGATTCAA AAGTCAGTTA 960
AAGTTACCGC TCGGTTATGT CACGTGACTC GCGTCACATT AATGTGGCTT ACTGATCATA 1020
GTTATTTTAA ACAAAAACAT TTATTACAAA 1050