EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-13417 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr25:3521172-3522941 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA9MA0594.2chr25:3521321-3521331CGTTTACGAC-6.02
RFX1MA0509.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.41
RFX1MA0509.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.41
RFX2MA0600.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.37
RFX2MA0600.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.37
RFX3MA0798.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.39
RFX3MA0798.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.39
RFX4MA0799.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.07
RFX4MA0799.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.07
RFX5MA0510.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.49
RFX5MA0510.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.49
Enhancer Sequence
TAACATTACG AGCTTGCAAA CTCACCTACA TCGTGGTTTC GCTGCAGGGC GTCTATCACT 60
GATGTTTTAA AAAAATAAAT AAACATTAAA TATGTTTAAA TGATCTCCGT TATCGAGTAT 120
GACACATAAA TGCTGCTCAA ACGATTAGCC GTTTACGACG CTAGCAAGCT AGCTGCTTCT 180
GTTACCATGG TAACAGCATG ACGCTCATCC TGATCCTAAT AATTCATTTT AAATTGAGTG 240
CCAAATAAAT AATAGTTGAG AAAACAGAAC GGATTATTTA AATACATTTT AACGTGTTGA 300
ATGTATGTTT AATATCACAA ATTCGACTAC TCTACGAGCA CGGAACTCGC TGTTTTTTCC 360
TCTGCATTCA CACGGAACGT CGGACACCAA CACGTCACTA AGTAGGCGGA GCTTTAGGGT 420
TTCCATCGTG CATTGGACGG TTTGAATCAA TGACAGACAT GCGTTTCCTC CAATAAGTAC 480
ACAACTTGCT TTTTCCTCAA ACCTGATTGG GTAAATCTGT CTTGACGGAC AGCAGTACTG 540
TCCAATCACA CTCAAGGATT CACTGAAGCG ACCGTTCGTA GCTTATTATT CGTCAAAGCA 600
GAATTTAAAA CTATTTAAAC CGTTTTGAGC GGGTGCCTAG AAAACAAGAG GCAGCCTAGT 660
CGAAGAGAGA AACTAGCTTC TAATGTTCAA TTAGCGACTA ATGTTTATAA ACAAAATACA 720
AGGAAGGATC GTAACTTCGG ATCGTCGGAT TGTTATTTTT GCAGCGCGAT CGTGAATAAA 780
GGCTAAAGAG GTAGATGTCG ATTTAACGTT ACGTTTTATT ATGCTGCTTT TTACGTTAGC 840
CAAGCTCGCT AACGTTATCG ATTCTTGAAA AAGCCACATC TGTACTATAA TCGCATGTTA 900
TGTTGAGTGT TTATGTTATT TTTAATGCTA AACCTTAGAT TACAAAAGAT GAAGAATAGT 960
GTCCTTTGTT GTTGTAATAT TCAATCTTTT TCATCTGCGT CTGTCTGTTT TGGGTTGATG 1020
TTGTTGAAAT GTTGATTTTA TTTATTCAAT GAAACGTTAA AATAAGTTAA ATGTGTTTAT 1080
ATTTGTTTAT TTGGTCAAAC TAAATGAACG AAGAAAACAT CTCATGCTTT AACTATGAAC 1140
GTGTGTTAAA TATTGATTAG TATTAATCAT TTGTAATTCT AAAATAACAT CTAACGTTAA 1200
TATCTGCCAC TAAAATGATC TGAATTTTCA TAAGAAACAG TCTAAATTGT TATTTTCTTT 1260
GTTGTTGCAT GACAGATTGA TTGTCTTGTC ATTTTATGCA AAAGTAACGC ATATAAGTAA 1320
CGTATGCAAA AGTAACGCAT ATATCCATTA TGTTTTTGTT GCTCGTTTCA ACTCTACAAC 1380
GGAAAAGGAA GTTAGTTTAA TGTTGAATGT GTTTTCAATG TGACATCCTG AAATGACAGC 1440
ATTGTGAAAG TGGGTTCAGG GCATCAGTTG CATACAAATT GATGTGTTTC TTCTAAAATA 1500
TATTGGTAGT TTATTCTGCT TGCATCATTG TTTTGTGTTA GTCAATAGTT AAAATTAATA 1560
ATTTAACCAT GTATTTCCAG GGGAGCCACA ATGAGTTCCT TACCTGAGGC CACACGCTCC 1620
CTCATGCAGG TTTTTAATGG AAAACTGCAG GATTTTACCA ATGAGATTGA TAATGTCCAC 1680
ATGGTTTGGC TGGAGGAAAT CCAGCAGGAA GCTTATCGCA TGTTTTCTAG GTAAGCACCA 1740
CTACTAAGCT GTTATTATGA ATGTATGAA 1769