EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-13356 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr25:249231-250531 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr25:249427-249448TTTTGCTTTCACTTTCGCTTT+10.36
IRF1MA0050.2chr25:249433-249454TTTCACTTTCGCTTTTCAGTC+6.11
IRF1MA0050.2chr25:249421-249442ATGCAGTTTTGCTTTCACTTT+6.69
IRF2MA0051.1chr25:249432-249450CTTTCACTTTCGCTTTTC-6.41
IRF2MA0051.1chr25:249426-249444GTTTTGCTTTCACTTTCG-9.45
IRF3MA1418.1chr25:249430-249451TGCTTTCACTTTCGCTTTTCA-6.24
IRF3MA1418.1chr25:249424-249445CAGTTTTGCTTTCACTTTCGC-6.33
RARA(var.2)MA0730.1chr25:249484-249501TGACCTTTTTTTGGCCT-6.31
Rarb(var.2)MA0858.1chr25:249484-249501TGACCTTTTTTTGGCCT-6.64
SOX21MA0866.1chr25:249878-249893AGCAATATTAGTGTT+6.56
ZNF384MA1125.1chr25:249585-249597TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr25:249586-249598TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr25:249587-249599TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr25:249588-249600TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr25:249589-249601TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr25:250497-250509ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr25:250498-250510TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr25:249590-249602TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr25:249591-249603TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr25:250496-250508AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
ATATTGAGAA ACTGAGACTC ACGCTTGTCT TCGGTCAGTA ATCTCTTTAG CAGCTTCTCC 60
ACGGTCATGT TCATCAGCTC ATCTTCTGTC TCCACGTTTA CTGTCAACAA CTGGCCGGCA 120
ATTGTGCGAA CAAACACCCT GCAGCTCATC TTCAACACGG GGAAATGGAC ACATATGATG 180
GCGTTGGTTG ATGCAGTTTT GCTTTCACTT TCGCTTTTCA GTCAAAACAG CAAGAGATCG 240
GCCAGAAGCT GATTGACCTT TTTTTGGCCT ACCTCTGGTT CTGACAGTAA TTTATTGTTA 300
TAAAAATATC AAATAGAAAT CTCTCTACAC ACTAAAAAAC GCTGGATTGT TAACTTTTTT 360
TTTTTTTTTT AAGAAATAGC TCATTAAATT GTCCATATGT TGGGATACAA CAACCCAGCT 420
TTTTAAAGAG TTTATACATA TAGTTGAAGT CAAAAGTATT TGCTCTCCTG TATTTATTCT 480
ATTTTAAATA TTTCCCAGAT GATGTTGAAC AGATTGAGGA AATGTTCACA GTATGTCTGA 540
TAATATTTGT TCTTCTGGAG AAAGTCTGAT TTGTTTTATT TCAGCGAGAA TAAAAGCAGT 600
TTTTATTGTT TTAAACCGAT TTTAAGGTCA ATATTATTGG CCCCTTCAGC AATATTAGTG 660
TTGGATTGTC TCCAGAACAA ACCACTGTTA TACAATGACT TGCCTAATTA CCCTAACTTT 720
ACCCTAATTA CCCTAGTGAA GCCTTTACAT GTCACTTTAA GCTGTATAGA AGTGTCTTGA 780
AGAATATCTA GTCTAATATT ATTTACTGTC ATCATGGCAA AGAGAAAATA AATCAGTTAT 840
TAGAGATGAG GTATTAACAC TATTATGTGC AGAAATGTGT TGAGAAAATA TCTCTGTTAA 900
ACAGAAATTG GGGACATCAA GGACTTCCAG GACAACACAC ACATTTAATA CACAAATACA 960
CTTCAGTAAA CATGTACAAA TAAACATCAC GTTTATGCAA TTAAACTGCA GTTTAATTTT 1020
GTCTGTATAT AATAACATAT ATTTGATTGT AATGCAATAA TGTGTACCAT TTTTAAAGCT 1080
GTTTTGAAAT AATCATGATT GTAAAAAATG CTATAAAAAT AAACTTTAAA TGAATTGCAC 1140
AGGACAGAGC TTACTGTACC CAAACCTTCT CCTCCCTCCA TACTCGGGTA TAACTTTCAG 1200
ACCACAAAGA AACAGCTTTG TGCCAACTTT AAATGGCAAA CAACGTACAA TAATGAAAAT 1260
GAACAAATAA AAAAAAAAAC AACAGAACAA AATATAAAGG 1300