EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-12930 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr24:12219087-12220515 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr24:12219178-12219197TTGTGCCCTCTTCTGGCTG-6.44
HOXA10MA0899.1chr24:12219228-12219239AGTAATAAAAA+6.14
HOXA10MA0899.1chr24:12219590-12219601AGTAATAAAAA+6.14
TP63MA0525.2chr24:12219848-12219866AACATGTTAAAACAAGTT+6.29
Enhancer Sequence
TTTAGACAAC ATTTCATGTA ATGTTAAACA TGTTAAAGCA AGTTGCAAGT GAAAATCTGT 60
ATCTCTGACT GAGTTTGCAT TACTGCTTAA TTTGTGCCCT CTTCTGGCTG GGAAAAGCTT 120
ATTCTGAGCT CTAATTCACC AAGTAATAAA AACAGCTTCA GCCACTAAAA AGCGTTTTCG 180
TTTTGTTTTA AACAACATTT CATGCACTGT TAAATATGTT TAAGAAAGTT GCAAGTGAAA 240
ATCTATGTCT CTGACTGAGT TTGCATTACT GCTTAATTTG AGCTCTCTAC TGGCTGGGAA 300
AAGCTTATTC TGAGCTTTAA TTCACCAAGT GATAAAAACA GCTTCAGACA CTAAACAGCA 360
TCATTCTTTT TCATTTCATG CAGTGTTGAA CATGTTAAAG CAAGTTGCAA GTGAAAATCT 420
GTGTCTCTGA CAGAGTTTGC ATTACTGCTT AATTTGAGCT CTCTGCTGGC TGGGAAAAGC 480
TTATTCTGAG GTCTCATACT GCTAGTAATA AAAACAGCTT CAGCCACTAA AAGGCTTAAT 540
TCTTTTTGTT TTAGACAACA TTTCATGAAC TGTTAAACAT GTTAAAGCAA GTTGCAAGTG 600
AAAATCTATG TCTCTGATTG AGTTTGCATT ACTGCTTATT TTGACCTCTG CTGGCTGAGA 660
AAAGCTCATT TTCAACGTCC AATACAGAAT GTGATAAAAC CAGATCCAGC CACTAAAATG 720
CATCATTCTT ATTGTTTTAG ACAACATTTC ATGCACTGTT AAACATGTTA AAACAAGTTG 780
CAAGTGAAAA TCTATGTCTC TGACTGAGTT TGCATTACTG CTTATTTTGA CCACTCTGCT 840
GGCTGTGAAA AGCTCATTTT CAACGTTCAA TTCAGAAAGT GATAAAAACA GATCCAGCCA 900
CTAAAAAGCA TTTTCTTTTA GACAACATTT CATGCACTAT TAAATATGTT TAAGAAGGTT 960
GCAAGTGAAA ATCTATGTCT CTGACTGAGA TTGCATTACT GCTTATTTTG ACCTCTCTGC 1020
TGGCTGTGAA AAGCTCATTT TCAACGTCCA ATTCAGAAAG TGATAAAAAC AGATCCCGCC 1080
ACTAAAAAGC ATTTTCTTTT TGTTTTAGAC AACATTTCAT GCACTGTTAA ACAAGTTGCA 1140
AGTGAAAATC TATGTCTCTG ACTGAGTTTG CATTACTGCT TATTTTGACC TCTGCTGGCT 1200
GAGAAAAGCT CATTTTCAAC GTCCAATACA GAATGTGATA AAACCAGATC CAGCCATTAA 1260
ATGCATCATT CTTTTTNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1320
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNAGAT 1380
CCAGCCACTA AAAAGCATTT TCTTTTTGTT TTAGACAACA TTTCATGC 1428