EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-12895 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr24:9335206-9336420 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr24:9335597-9335609ATTGTAACAATT-6.74
HNF1BMA0153.2chr24:9336286-9336299GTTAATTATTAAA+6.14
PRDM1MA0508.2chr24:9336306-9336316TCACTTTCAC+6.02
SP1MA0079.4chr24:9336163-9336178TGGGGGCGGGGTTTG-6.37
SP4MA0685.1chr24:9336161-9336178GATGGGGGCGGGGTTTG-6.6
ZNF384MA1125.1chr24:9335619-9335631AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr24:9335620-9335632AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr24:9335618-9335630TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr24:9335617-9335629TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
TTAACATTGC AACCTTGAAG TCACGGACGT ATTTCTATTT ACGTGATGAT CAGTCAGGTA 60
TTTTGGGTGG AGAGTTACGG GGATTTGAAG TCACCATAGT AATGTGTGAT GTAAGAGCTG 120
TCTTGGCTCG GTTTACAAGT AGGTGAGCGC GCATAGAGCT GCTAAGGCAA TGCGCGAAGA 180
GGAGGGGCGC GTGAGACACT CCAAACACCC TCCAACACAC ACACACACTC CCTCCCGCAC 240
TCTTCCGTTG AGTGAACCGT ACTAACTCCG GGAATACATA CTAAAAGGAC ATGGCATACA 300
AATCAGCCTT CCTCCAAATC ATGGAATACT GAGAAAGAGT CAGAACTGAG GACGACTGTT 360
TTGGACGTGC CTGTATACTG TGAAATAAGG TATTGTAACA ATTCCTCATA CTTAAAAAAA 420
AAAAAACTTG CAGCTTGTCT TCATAAACTC AGCGTATTCT GCAGAAAGCT CGCGCGATCG 480
TCTCGATTCA GTCTTGCGCG CAAACTTCTG GACGCAGCGC GATCTGTAAC TGGAGAAGGC 540
GCGCGCATGT TTGCTTTTCT GGTGTTACTG TTGCAGTAAG AAACCCGATA TGCGATTCAT 600
TCTGGACTGT GGCACGGCTG GAAAGATGCG AACTAAAAAG ACAACAATGG CAGGGGTCTG 660
TGCTAGTTGT AACCAGGTGT GCGCGGGGGG CGCTTGGAAC GGACTGCGGG AGGTTTGAAA 720
CTTAGCAGTA GTTTGGATTT TTATTATAAC TTATCGTCTG TCCCATCGTG CCAGTTTCTC 780
ATTTAATTAA GAAAAACCCA TTAAGGTTTT GTGTTTTGAG TTGTCATGCT TTGGTTTGCG 840
TGGGTTGATG CATGGAGTGA GGCAATGGGC TTGGTGTTGG CATGTGTCGG CGTGTTAAGT 900
TTACAGTAGT AGAAGTTTAT AGGGACACTT TAAATTGGCT GGGGCCAAGG TGTGGGATGG 960
GGGCGGGGTT TGACAGCAAA ACGAAGAAAC TCTTTATATG AAAGAATCTT CTAAATAAAT 1020
GTTTTATTAA TTTTAATAGG TACCTACATT TTCAGTTTAT AATGTATCCA AAACAACTGT 1080
GTTAATTATT AAAGTAAATA TCACTTTCAC CAAGTTCAAA TCCTAGCATC TCATGATAAA 1140
CCTACATGCA GATGTTGGGA TGTAACATAG GAAAACATCC CCTGTTGTTT ATGCAAGAAG 1200
TTTGTTATGA GCTA 1214