EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-11996 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr23:12507406-12508816 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr23:12507581-12507592TTTTATTGCTT-6.32
HOXD9MA0913.2chr23:12507580-12507590GTTTTATTGC-6.02
RFX5MA0510.2chr23:12508185-12508201CGTTGCCATAGCAGCA-6.14
RFX5MA0510.2chr23:12508185-12508201CGTTGCCATAGCAGCA+6.1
Sox1MA0870.1chr23:12507556-12507571CACAATTTCATTGTG+6.61
Enhancer Sequence
AACCAAAGAG CTGATTCTTA CATAGTGGTG GAGAATAATT CGGGCACGCA GATCTAACTT 60
TTAAAGCACA AAACCAAGAA ATCACATTGT TAATCTTTTC TATTTTTGTC CGGAAAGAAT 120
AGATTAGAAA GAACAGAAGT TTTGTTACTG CACAATTTCA TTGTGGTACC ATTTGTTTTA 180
TTGCTTGACT ACATTTAGTG TTGTTAAGAA AGTAAAACAT TATTTAAATT GTCCGCCGAG 240
ACAAACTGTA AGCCGCTCTA AAGCGCATGT AGAGAAAGAC AAAGCGTATT CCTTTGTGCT 300
TATCTCATAA CGTTATATAA GGCCTTCACA GTATGATTTC GTACGCCGCG ATTCCCGGAT 360
GGAAACTCAG CTGTGTTTTC TCCTGGTAAC CGATTTAGCA TAGCTAACTA AATTCTTGTT 420
GCCCTGTAAT TTGCTAATAC TTAGTAAATT ATTTAAAACG CGGAGCTCAG AGAGAGCTGC 480
CTAGCGTAGT TTATAGGAGA AGTTTTGAAA TTGATCAATT GAAATTGTGG TTTGAATCCA 540
CGGATGTGTT TGCAGTCTAA ACAGACTTAA CACAGAGTGC TGAGATCCCC CATATCTCTG 600
TCACAATTTG TATTAATCTC AGAAATCCTG TTGATTAATT GTGTCTCACT TTCATAAGTT 660
GAGAATCATT CAGTACTGTT AAGATATAAA ATCTAACTAG TGCTTTTTGC TTGAACAGTG 720
TGAGATGCGC CGCCATCTCA AGTGATACTG TGAAATTTGC TATTATTCCA CTTTGTGGTC 780
GTTGCCATAG CAGCAACCTT GGTCCGGAAG TACAGAGAGA CTTGCCGGAA TTGCATTCAA 840
GCGCGCATGT GCAGTCCGCC AGCGCCAGCT TGAATTGTAA ACAAAGAGCA TAGCGTGAAG 900
CTAAGCTAAA CTAACGCTAA CGCGTTTGCA TTGAAGTCTA TGCATTTCCA GTAGCAGCGA 960
AGGCTAATAG ATAGCACGTA GCATTTAGTG GTCTTTAATG CATTGAATGG CTGATGTTTG 1020
AAATAACTCT TGCATCTAAG TTGTTTCTCT TTACTCACCT TGGAAAAGTT GACAAATGCA 1080
AAGTTAATAA AAGTGTGCAC GATCTAACTG CTGAGTTTAA TCACCATCAT TTTATTATTA 1140
TTATATTTTT TCCTGCTGTA CTTGGCCTGT TGAATTTGAT CAGTTTGAAC TCACATAAGC 1200
TGTTGGTTTT ATTAGTGATG AATTATAGTT TTGTTTTCAT TACTATAAAT TAATGCTCTC 1260
TGACCTGTTC AAGAATAAAT ACTTTTTCCA TTCATCAACA TCTAGGAACA CCCATTTCCT 1320
ATAACTGTTG ATTTATACGG ATAAGACTCA CTGATTAAAT AAATTGTAAT TGTTTAATTT 1380
AATGATAAAC TGCATTAAAT GTTACTCTAA 1410