EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-11871 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr23:1125282-1126677 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr23:1126215-1126236GGAAAAAAAGTGAAAGTGTTT-6.23
NEUROG1MA0623.2chr23:1125514-1125524GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr23:1125514-1125524GACATATGTC-6.02
POU4F2MA0683.1chr23:1126053-1126069TTGAATATTTAATCAA+6.16
Enhancer Sequence
TTCATTAGTG CTCACCTTAC CTCCTGTCCT CCATCCATCC ATCTATTCAT CCAGGGTTTG 60
TCAACATACA TGATTCAATG CCATACAACA TTCCGCAAAA ACCTCAAGAA TCTTAATTTT 120
CCGGCATGTT TTACTCCTCA TGTGTACTGC AAGCCGTAAG TTTATCTTCA TTCTTGTTAC 180
AGTAAAGCAG ATTAAAAAGT GTTTTACCAG GAGTGGGGTT CGAACCCACG CGGACATATG 240
TCCATTGGAT CTTAAGTCCA ACGCCTTAAC CACTCGGCCA TCCTGGTGAA CATACATTTC 300
TTTAAAGCCA GAAGACCTTA TATGTGAACA GCAATCAGCC ATGGGAATAT CAAACTATGT 360
ATGTCTAGAT GTGAAATTTA TGTAATCTAT GCATGCTGTT CATGCAGACT TTACTGTCAT 420
ATTTACAACC GAGTTGCAGC TTGCTAACTG ACTGTTAGCA TGCTAGTGGA CTCGCTTACA 480
AAAACAACCA AAACGTTTAT ATACGTTTGA TTTTTAACTA GCGTACACGA TTGAAGACTA 540
TTTATAAATC TAGCCATTTT TATAATGCGA TATTTTAAGT CGTTTTTACA ACAATGAGGT 600
TATATTGTTT GACGTTTGTC TCACAGTTAG AAAGAGCGCT AAGAAGTAAG TTAAAGCTAA 660
TGCAAACATC CAGGCTCCTT ACGCAAGCGT ATGTTGTAAC AATATTTCGA AAGTAAAAAG 720
AGAACAAGAT TCCTGTGTTA CATTATGTTT TGAAACTGCA AATACGGTAT TTTGAATATT 780
TAATCAAATC AGAAAAAGCT GTGACTTAGA CTGTTGGTAA ATCCATGGTA AACCCTCATA 840
ACTCAGCCCT GCCTCCACGT AAGTGCCACA CACAGACGGT TTGGATTGTT TCTGCTTTTC 900
TGAAGTGAAA GAGGAAATAA AATCAGGTTG TTTGGAAAAA AAGTGAAAGT GTTTCAGTAG 960
CTACTCGTGT CTGTAATTGC TAATACTTGA TCTATTTGAG GAGAGAAGAT GAATTTATGT 1020
AGGGATAGCT CACTCCAAAT TTTCTGTCAT CATTTACTCA TCCTCCACTT TCTCTAAAGT 1080
TAAACCTTTT GTTTCTTCTG TTGAACAAAA AAGAAGATAC ACTGGTGTGT GAAAATCCAG 1140
CTTAAACCAG CCTAGGATGG TTGGATGGTT TTAGCTGGTC GACCAGCCTG GTTTTAGAGG 1200
GTTTTGGCCA TCTCCAGCCT TTGCTGGTTA GCTTGGTAGA TGACAAGCTA AATCAGCTTG 1260
ACTAGCCTAG CCAGGCTGAG AGCTTAGCCA AAACCAGCTA TGTCCAGCCT AAAGCAGGCT 1320
GGTCAAGTTG GTTTTAGCTG GTCAAATTCC GGCCTGACCA GCTAAGACCA GGCTGAAAAG 1380
GGCTGAAACC AGCCT 1395