EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-09774 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr20:20002462-20004887 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr20:20003998-20004015AACATTAATTAATTTAT-6.01
ArxMA0874.1chr20:20003887-20003904CAACATTAATTAATTCA+6.19
ArxMA0874.1chr20:20003888-20003905AACATTAATTAATTCAT-6.42
Lhx3MA0135.1chr20:20004000-20004013CATTAATTAATTT-6.54
POU6F1MA0628.1chr20:20003891-20003901ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20004001-20004011ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20003891-20003901ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20004001-20004011ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
ATAATCTTGA CGGTCCAGGA TCAACATTAG TGAATTTATA AACTTGATGG TCCAGGATCA 60
ACATTAGTGA ATTTATAAAC TTGATGGTGA TTAATCAACA TCAGTAAATA TATAATCTTG 120
ATGGTCCAGG ATCAACATCA GTATATTTAA ATTTTTGATG GTCCAGGATC AACATTAGTG 180
AATTTAGAAA CTTGATGGTC CAGGATCAAC ATTAGTAAAT TTATAATCTT GATGGTCCAG 240
GCTCAACATC AGTGAATTTA TAAACTTTAT GGTCCAGGAT CAACTCTAGT GTATTTATAA 300
ACTTGATGGT CCAGGGACAA CATTAGTAAA TTTATAAACT TGATGGTCCA GGATCAACAT 360
TAGTGAATTT ATAACCTTGA TGGTCCAGGA TCAACATCAG TGAATTGAAA TTTTTGATGG 420
TCCAGGATCA ACATTAGTGA ATTTTAATCT TGATGGTCCA GGATCAACAT CAGTAAATTT 480
ATAAACTTGA TGGTCCAGGA TCAACATCAG TGAATTTATA ATCTTGATGG TCCAGGATCA 540
ACATTAGTGA ACTTATAATT TTGATGGTCC AGGATCAACA TTAGTGAACT TATATTCTTG 600
ATGGTCCAGG ATCAACATCA GTGAATTTCT AATCTTGATG GTCCAGGATC AACATCAGTA 660
AATTTATAAA CTAGATGGTC CAGGATCAAC AATAGTGAAT TTATAATCTT GATGGTCCAG 720
GATCAACAGA AGTGAATTTA TAATCTTGAT GGTCCAGGAT CAACATTAGT AAATTTATAA 780
ACTTGATTGT CCTTAATCAA AATCAGTAAA TTTATAATCT TAAAGGTCCA GGATCAACAT 840
TTGTGAATTT AAATTTTTGA TGGTCCAGGA TTAACAGTAG TGAATTTATA ATCTTGATGG 900
TCCAGGATAA ACATATGTAA ATTTATAAAC TTCATGGTCC AGGATCAACA GTAGTGAATT 960
TATAATCTTG ATGGTCCAGG AATAACATTA GTGAATTTTT AAACTTGATG GTCCAGGATC 1020
AACAGTAGTG AATTTAAAAT CTTGATGGTC CACTATCAAC ATCAGTGAAT TTAAATGTTT 1080
GATGGTCCAG GATCAACATT AGTAAATTTA TGATCTTGAT GGTCCAGGAT CAACAGAAGT 1140
GAATTTATAA TCTTGATGGT CCTGGACCAA CAATAGTTAA TTTTATAAAC TTGATGGTCC 1200
AGGATCAACA TTAGTGAATT TATAAACTTG ATGGTCCGGG ATCAACATTA GTAAAATTTA 1260
ATCTTGATGG TCCAGGATCA ACATTAGTGA ATTAAAATTT TTGATGGTCC AGGATCAACA 1320
TCAGTAAATT TATAATCTTG ATGGTCCAGT ATAAACATTA GTGAATTTTA GGCTTGATGG 1380
TCCAGGATCA ACATCAGTGA ATTTATAAAC TTGATGGTCC AGGATCAACA TTAATTAATT 1440
CATAATCTTG ATGGTCCAGG ATCAACATGA GTGAATTTAA AACTTGATGG TCCAGGATCA 1500
ACATCAGTGA ATTTATAAAC TTGATGGTCC AGGATCAACA TTAATTAATT TATAATCTTG 1560
ATGGTCCAGG ATCAACATTA GTGAATTTAT AAACTTGACG GTCCAGGATC AACATTAGTG 1620
AATTTATAAA CTTGATGGTC CAGGATCAAC ATTAGTGAAT TTAAATTCTT GATGGTCCAG 1680
GATCAACATT AGTGAATTTA TAAACTTAAT GGTCCAGGAT CAACATTAGT GAATTTAGAA 1740
TCTCGATGGT CCACTATCAA CATTAGTGAA TTTATAAACT TGATGGTCCA GGATCAACAT 1800
TAATGAATTT ATAATCTTGA TGGACCAGGA CCAACATTAG TAAATTTTTA AACTTGATGG 1860
TCCAGGATCA ACATTAGTGA ATTTTAATCT TGATGGTCCT GGATCAATAT CAGTTAATTT 1920
CTAATCTTTA TGGTCCAGGA TCAACATTAG TGAATTTCTC ATTTTGATGG TCCAGGATCA 1980
ACATTAGTGA ATTTTTTACC TTGATGGTCT AGGATCAACA TTGAGTTTAT AAACTTAATG 2040
GTCCAGGTTC AACTTCAGTG AATTTATAAA CTTGATGATC CAGGATCAAC ATCAGTGAAT 2100
TTATAAACTT GATGGTCCAG GATCAACATT AGTAAATTTA TAAACTAGAT GGTCCAGGAT 2160
CAACATTAGT AAATTTATAA TCTCGATGGT CCAGGATCAA CATTAGTGAA TTTAAAATCT 2220
TGATGGTCCA GGATCAACAT TAGTGAATTT AAAATCTTGA TGGTCCAGGA TCAACATTAG 2280
TAAAATTTAA TCCTGATGGT CCAGGATCTG TCAGGGTTCT TAAAGAGACA CAAATGCAGG 2340
CTTGAGAGAA TCAGGGGAAT TTAATTTCAA TATCCAAACA AAATATCTTT CTAGAAAAAG 2400
ATTTTTAAAA AGAATGTAAA AAATC 2425