EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-08823 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr2:14338092-14339470 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr2:14339019-14339030ATAATTAATAT-6.02
NFKB1MA0105.4chr2:14338200-14338213TGGGGATCCCCCT-6
NR4A1MA1112.2chr2:14338445-14338455GTGACCTTTA-6.02
Enhancer Sequence
GCTGAGATCT GGACATCCCA CCTGCAATCT ATTCCATTCA TAAAAATAGG TGGTTGCTGG 60
ACAGTGGAAT TTTGGGGTTT TAAAAGCAGG GGGCAACTCA GGGGGAGCTG GGGATCCCCC 120
TTCAAAGGTT TTTTTTGGGA TCTGTTGAAG TTTGACCACT TGGGTGGGTG GACCATGTAA 180
AACATCCCAC GTGTAACTTA TTTGACTGGG CCCAGATAGG CTGTTTGTGG ACAGTGCTTT 240
TTTTGGCCAC AGAAGTTGTT TCGTGAGATA TGATGAGGAA AAAACTGCAT GGCAGGGATT 300
CCTGACCCCT CTGCTCCTAA TAATGTACTC CAAAATTGTT CCTGCTCTGA ATGGTGACCT 360
TTAACAGGGG TGTCCACGGA CAGCCTACTT AGGCCTGTTC AAATAAGTTA CAGGTGGGAT 420
GTTTTTTCTT GATCCATCAG ATAGAGTTGG AATATATATA TACACACACA CACACACACA 480
CACACACACA CACACGTATA TATTTATTTA TTTATTTTTT AAATCTTTTT TATAATAGTT 540
TTTAATCTTT TTTTTTCAAA ACTACTTTTA TTCTTCCCAA AATAAAACAA ACAAGACTTT 600
CTCCAGAAGA AAAAAATATC AGACACACTG TGACAGTATC AGACAGAGAT TAATTTGCTC 660
TGTTAAACTT CCTATCTAAT AACACAGAGG TCAATGCAAA TTAGCGCCCC CTATAATGTT 720
TGAACCTGCT ATGGTACTGC AGATTTTAGC CATTTCGAAC ACATGCCATA TCCCCTTTTG 780
TACACTAGAG GGGGCAATTT AATCAACATT TCCAGTGGGG GTTATTATCA GGGATTTGTA 840
ACTGCACAGA TATGATTCAA TAAAGGACAC TTACTGCATG GATGGATGGA TGAACAGACT 900
ATATATATTT ATATAATTAT AATTTATATA ATTAATATTT ATAATTTATA ATTAAATGTA 960
TATAATTTAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 1020
ATAATAATAA ACACATATCA GACACACTGT GACAGTATCA GACAGAGATT ATTTGCTCTG 1080
TTAAACATCA TATCTAATAA CACAGAGGTC AATGCAAATT AGCGCCCCCT ATAATGTTTG 1140
AACCTGCTAT GGTACTGCAG ATTTTAGCCA TTTCAAACAC ATGCCATATC CCCTTTTGTA 1200
CACTAGAGGG GGCAATTTAA TCAACATTTC CAGTGGGGGA TAACATCCCA CGTGTAACTT 1260
ATTTGACTGG GCCCAGATAG GCTGTTTGTG GACAGTTCTT TTTTGGGGTA CAGAAGCCTT 1320
TTGGTGAGCT CTGAGGTGGA AAAAACTGTT GATTGGGGCC TCCTGACCCC TCTGCTCC 1378