EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-08329 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr19:26494219-26494877 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr19:26494526-26494541TTTGTTTGTTTTGCC-6.04
FOXE1MA1487.1chr19:26494546-26494561AATGTTTGTTTTGGG-6.04
FOXE1MA1487.1chr19:26494294-26494309TTTGTTTGTTTTGTC-6.05
Foxd3MA0041.1chr19:26494604-26494616GATTATTTGTTT+6.07
Foxd3MA0041.1chr19:26494265-26494277GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26494521-26494533GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26494525-26494537GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26494261-26494273GATTGTTTGTTT+6.92
Foxj3MA0851.1chr19:26494733-26494750AGTTTTGTTTATTTTTT-6.35
IRF1MA0050.2chr19:26494418-26494439GTTTAGTTTCTTTTTCTTGTT+6.43
LMX1BMA0703.2chr19:26494820-26494831AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr19:26494835-26494846TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr19:26494824-26494837TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:26494828-26494841TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:26494825-26494838AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:26494829-26494842AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:26494832-26494845TAATTAATTAAAT+6
Lhx3MA0135.1chr19:26494821-26494834ATTTAATTAATTA-6
PHOX2AMA0713.1chr19:26494819-26494830TAATTTAATTA+6.62
POU6F1MA0628.1chr19:26494826-26494836ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:26494830-26494840ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:26494826-26494836ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:26494830-26494840ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr19:26494819-26494830TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr19:26494819-26494830TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr19:26494819-26494830TAATTTAATTA+6.62
ZNF384MA1125.1chr19:26494844-26494856TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:26494845-26494857TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
TTTTATTTTT TGGTCAGTTT TGTTTTGATT TGTTTTTGTT TTGATTGTTT GTTTGTTTGA 60
TTAGTCTTCA TGTTTTTTGT TTGTTTTGTC TGGCTTCTTG GTTTATTTAT GTTTATGTTT 120
GGTTTGTTTT GGTCTGTTGT TTATAATTGG TTGCTTGCTT TTTTGTGGAT GGCTGTTTGG 180
TTAACTGCCT AATAGTTTAG TTTAGTTTCT TTTTCTTGTT TTTTGTTGAT TTAGTTTTGT 240
TTGGTCTTTT TTGTGGTTGT TCATGCTATG TTTGTTGTGT TTATTTGTTC ATTATTTTTA 300
TTGTTTGTTT GTTTGTTTTG CCTGATTAAT GTTTGTTTTG GGTTTTTTGG TTGGTTGGTA 360
ATCTTTTGTA GATTAATTGT TGCTGGATTA TTTGTTTGGC TTGTTTTTGT TCGGTTTTGT 420
TTTGGTGTTT GTTGTTTTGT TATTGACTGC TTACTAGTTT TGATTTTGAT TTGATAGTTA 480
TTTGATTTTC TTTTTCTTGT TTTTTGTTGA TTTTAGTTTT GTTTATTTTT TTTAGTAGCT 540
GGTAGTCATT TTGTGCTGTT TTTATTTGTT TGTTAATTTT TATTGTATGT TTTTTCCCCC 600
TAATTTAATT AATTAATTAA TTAAATTTTT TTTTTTTTGG TTGGTAATTT TTTTGTAG 658