EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-08012 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr19:12141052-12142151 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr19:12142007-12142024AAAAAATAAACAAAACA+6.57
POU4F1MA0790.1chr19:12141627-12141641CATAAATAATTCAG-6.26
POU4F3MA0791.1chr19:12141625-12141641TTCATAAATAATTCAG-6.44
ZNF384MA1125.1chr19:12142027-12142039AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr19:12142028-12142040AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
CCTTGAGACA AATGCCATGG CAAGCAGATA ACATTCAAGA AAGATAAAAT GCCATTAGCA 60
GCCAGTCAAG ATGCACATCA CTCTCATTTG GTGTGCATTG CATTGCGCTT CCAACACAAC 120
AAACATTAAG CGCCAGATAA CATCTGCACA ATGGGTTTAG TCTTGTTCTG ATAACATGTA 180
TGTGCAAACA GCTCCTACTC GTTTTAAAGA AAAATTTCCA TCTCAAGTCA AAACTAAATA 240
AAAGTCTAAG AAAGAAATGA AACTGAGAGC TACAATGCAA AACAGCTGAC ACTGTTAAAC 300
ATTCCCAAAA CACACCTACC TCGTCTAACC AGTGCGGTAT GCTGTTTAGA CGCATCATAT 360
CAACATTACT CAAATATTTC AGGTTAATCA AGGACAATTT CCCATGCTTG TTTTTCTCAG 420
TGACTACAAT GACTATAAAT TAAGGTGTCT GGTTTTTATC TTTTGCTCTA AGACAACTAT 480
AAAAATTACT AAATGACATA TCTGTGAGCT CAGAACCTGA ATGAGGAATC ATTCTGTTTT 540
GTTATAACAA ATATAATGGG AATAAACATA ACATTCATAA ATAATTCAGC CTTTATAAAG 600
AGAATGTGTC ACGATGTTCA AAGTAAAAGA CAAAAAGTAG CAATGTTCCA GCGGGGGTTC 660
TTTGTTTACC AAAGGGGTCT TGGGGAGTTC GTGTAAACAC TGGAGGAGTT AATTACATCT 720
GTAAGAGCTG CACAGAATTT CATTTATTGG GTGTAAATGC TTTTATAGCA AACAAACACA 780
CTGTACCCTA GAGACAACAG ACAAACAATC CAGGCGAACA AGCTAGGGCA AAAGAAAACC 840
ATTTTCTAAA TGTTGTTTCC TTATCACAAC AATCATTTTT AACTACTCAA AATTCGTTTA 900
TGACTCTCAT AAAGAGCTGA CTGCTAAATG GCCAGTTGAC AAAGCATTTT AACTTAAAAA 960
ATAAACAAAA CAAACAAAAA AAAAAAAACT GAGAGGAAAA GTTTAGTTGT AACTTGATAC 1020
CAAATGATAC CAAAAGCATC TTGTCAACTA CACTTGAAAC AATATCAGTT AATTTACCGT 1080
CACAAGTGTT TTCTGTTTA 1099