EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-07137 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr17:52819457-52820107 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr17:52819715-52819730TGACCCTTCACCTCT-6.19
RARA(var.2)MA0730.1chr17:52819704-52819721TGACCCCTGCGTGACCC-7.48
Rarb(var.2)MA0858.1chr17:52819704-52819721TGACCCCTGCGTGACCC-6.44
Enhancer Sequence
ACACACACAC ACACACACAC ACACACGTTT TTGTGTTTCT CTGTGTTTGT GTGTCTGTAT 60
TTTTGTGTGA TTGTGTGTGT GTCAACATAT GTGTGTGTCT CTGTTTGTGT GTCTCTCTCT 120
CTCTGTATTT GCATGTGTGT ATGTTTGTGT GCCTCTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 180
CTCCAGCAGT GTTGGTCTTT GTTGTGAGCG TCAGTGAAGG ACACATTCTG TGGTATATCC 240
AGAGGAATGA CCCCTGCGTG ACCCTTCACC TCTGCTTTAA TTATTTGTTT GAAGACCGCA 300
TGAGGTTCCC ATGCAGAGCG CAGCGGCGGC AGCGGGGGAC TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 360
TTCAGCTTGT TCAGCTTCAG TAAAGACTCT AACAGACACA CTGCATCATC ACTATGCCTA 420
TATTAGTGTA GTAACGTCTG TACAGCTGTA ATATTTACAG CGCTCACACC AAACCCGCCA 480
TCACATTCAG CACAGGGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GCTGGCGGGT GTTGTTCTAA 540
GCACACCCCA TTAGCAGCTC ATGTGTGGAG GTGAACAGTG TTATCAGAGT CTGGTCTGAT 600
AATCTCATTT GGCTTTACAC ACACGCACAC ACACGCGNNN NNNNNNNNNN 650