EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-06380 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr17:4348039-4349645 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr17:4348896-4348908AAATGTTACATT+6.52
LHX2MA0700.1chr17:4348709-4348719ACTAATTAAC+6.02
LMX1BMA0703.2chr17:4348936-4348947AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr17:4348937-4348950ATTTAATTAATTT-6.07
NFIL3MA0025.1chr17:4348675-4348686TTATGTAACAT+6.32
Enhancer Sequence
ATATTAAAAT TAACACCTAA AGCATTTGCC TTCTCAGCGC TGACTATTGT GATGTATTAT 60
AAATATTGTG ATTCGTTTGT TTCATCTTCA GGTGTAATAA ATCAGGTATT TTGAAAGATA 120
TGAGTTGTGT TATTGTTATT AATAAGTTGG AGCTGTCTGA CTCAAAAACC TTTAAAGGTA 180
TTGTGAAAAT CCTTTAAAAT GTGTGGTGAA AAGGAATAAA TACAAACTCA ATTTTGCTTT 240
GTGTGTCAAT TGTACAGCAT CTCAGATCAA CACATCTCAT ATTAAATAAG CTTGGATTTG 300
AAAGTCATTG AGAGACGGAT TGTTGATCGA ACATGTTTAA AGCTGATCTT ACTGTAGTTG 360
CTGACCCCAC ATTGAAAATG AATGGGAATT TTGTTTTAGA TGAATCTGTC CAAAAGAAAT 420
GTGAAGTAAA TAATAAATTA TGTGTGTAAA TTGCTGATTT TTTTCCTCTC AGATGGCAGA 480
ATTTTATTTC TAAAATCTAA AACAGTATGC AGAAACCTTT AGGTCAGACT TTTAGTGATT 540
TTTCAATGAA AAGTTTATTT TTTTTAAGCA GATGGCTTAT TTTAATGCCG TGAAACAATT 600
AAACCTCTTC AATATGAGTG TATTTATTAT ACAGGTTTAT GTAACATGAT GTACATTATG 660
ATCCATGTTT ACTAATTAAC AAGCAATAAT TTGATCACAC TTTAATACAA TTCTCACTAA 720
TAATGAACCT TTAACTATGT GACTTTTCCT TTAATAAACT GTCAATTTGC TGTGTTCACT 780
CAGATTAATC AGTGGTTTTC TTCATTTCCC CCCAATTATA ACATTTATTG TGATTTGTGT 840
TAATTATTAG GTAGTCTAAA TGTTACATTC ACCAACCCAA ATGGGGTAAT CTAAAACAAT 900
TTAATTAATT TAGTATTAAT TTAGTATTTT GGGAAATTAA TTTTGAAATA TTCTCCGCGA 960
ACTGTAAAGC CCGCCCTGTT TGATTTGATT GGCTGACATT TTGACATTGA CGAGCTGTTA 1020
TTTCTGAGGC AGACTCTGAC AGGAGCTGTT GTGTATTGAT TACGGCCCGG TTTCAGATAT 1080
GAAATCAGTG CTGGCTCGGT AATATTCACT CATTTCTGTG CTGTTCTGAA GAATCTGAAC 1140
TTTTGAAAAT AAACGCGGCT AGAGACGCCA TTCCAAAAAT TCCATAAGTG ACGTCACGCG 1200
GCTAACCACT CTCCAGTTCA GTGATTATCA AGCTAGTGAA AGGATTGTCA TTTGAGCGCG 1260
TTTACAGAGT TTGAGTAAAT GGATCGATTT ACTAATTATC TGTCGACTTA CAGCACTTTT 1320
ACGAGTGAAG TAGAACAATT TATGAGTGAA AACACGATGC CTGTGTTTGA CCACGCGATG 1380
GCAGCAACAG CATCTGTGTG TGGTGGAATG GAGAAAGCGG AGGCAGGTTT GTGGCTCGAC 1440
ACAATCGGCT TCTGCGACGA CTTCTGTCCC TGGCTTGACC AGGTGGACGG GACTGTGGTT 1500
TCAGAGGCCG CTACAGCACT TCACAAGCCC TCTACTGCTA ATAAAGTGGA GAGAAATGCA 1560
ACCGGTGAGA CTATCAGCAA ACACTCANNN NNNNNNNNNN NNNNNN 1606