EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-03778 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr13:45814179-45815123 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr13:45814540-45814551TGCCATAAAAC+6.14
IRF1MA0050.2chr13:45814682-45814703AAAAGGAAACAGAAAGCTGGT-6.07
IRF3MA1418.1chr13:45814679-45814700CGAAAAAGGAAACAGAAAGCT+7.2
Enhancer Sequence
CCAGTTAAGC ATTGAAAGTC CAGCAAACCT GCACATCATT GTCTAGTTAA CAACACACAT 60
CACCGTCACA CACTCTTTAA ACACACACTC ACAGCTGTCA GACCTGAATA CTGCAGCACA 120
CGCCACGGCA AATCCTAAAA CACAACAGAT TGGACAGACG CACACAGACT CACACACACA 180
CACTCCCCCT CGGTGAGCCT GTGACAGTGA TAAACGTGTC GAGTGTGTGA AAGGGACAAC 240
AAACAGACAA CAGCCCATTT CCACAGTATG TGTGTGTGTG TGTGGACACA GGAGGAGCAT 300
CCAATTAGAG GCTGGGCTCC ATGCGGGGCC CGGGGCCGCA GGTTTTGTTT TCTTGAAAAA 360
GTGCCATAAA ACAACTCTCC TTAATTGGCG CTCTATAAAA TTAGCATCTG CAAGAGTGCT 420
GGATTTCCTC TGGCCTTTGT GCGTGTTGTT GACCTTATTC ACTTTCAGTT ATTTATCTGC 480
TTTTTTTTAT TGCAAAAAGC CGAAAAAGGA AACAGAAAGC TGGTGTGGAC TTTCTCTTCC 540
CCCCAATGCT GTCCGGTCAC GCTTCGTTCT GCCGTCTTTT GATCCGATCG CGACCTATGG 600
AGACATTCAT GAGCGCATCA TTAACACTTT AAGCAGGCTT TATTTGACGC TTGATTTTTT 660
TACACTGTCG TAAGATTTTA AGCCCAAAGG GAATGGGGTA ATGGCTCTCA GTGACTTTTA 720
ATAAGAAGCA ATAATGACAG ATGTTGTAAT TAAGCTCCGC GGATCATTGA AAAATGCAGA 780
TTATTACCGT GGAAAGGGAC ATTTAGGGGT TGAATCTTTC TTTTAATCTA AAATAGTTTA 840
CCCTTTAAGT TTGAAGGATA CACTCAAAAA ATTGTGTTTG CTATTTGTTC AAACTGCTTA 900
TTTAAACTGA GCTGAATCAA CACAGGCGTC ACGGTGGCTC ATTG 944