EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-03335 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr13:18524214-18525132 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr13:18524732-18524743GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr13:18524732-18524743GTTTTATTGGT-6.32
IRF3MA1418.1chr13:18524841-18524862GTTGAACGGAAAGTGAAACGT+6.09
Enhancer Sequence
CAGTCTCGGA GAGTCCGGTC CCATTTTCTA TTATATAATA GTTATCGCTT CTCGGCCTTT 60
TGGCTAAGAT CAAGTGTAGT ATCTGTTCTT ATCAGTTTAA TATCTGATAC GTGCCCTACC 120
CGGGCACCAT ATATTAAATT GATTTTTGGA ACAGGGAGAT GGAATAGGGG CTTGCTCCGT 180
CCACTCCACG CATCGACCCG GTATTGCAGT ACCTCCGGGA ACGGTGCACC CCCTAACCTG 240
GTAAAAAATA GATTAATAAA TGAATGGAAA TGTTAAAGTA TAGAAGAAGC TAGCCGTACG 300
AATGATGTGT ATCAACGAAT TAAGCAGGTG GCTTATCACA TATGTTATAC AATTTAATAC 360
GATGTGAAAA AATGCATATG ACGCTTGTTT GGCACTGGTA CGTGGTACTG AAGTGGATGT 420
TGTTCCCTGG TGGGATTTCA TTATTATAAT AAAGCATAAT GGAGCTGCCG AAGTTATGTT 480
CATACCTAAT TAACTGCACA TTAAGTATAT GATATTAGGT TTTATTGGTG TAGTTTATTA 540
AATCTCGTGT TTCCAGTCTG TGCTCTTACT AAACTAAGCC ACCCGACTAA TGAGTTTGTT 600
TTTTATACAA CAACAAATAC ATCTTGTGTT GAACGGAAAG TGAAACGTTG GTTTGCAGGA 660
ATCAATCGTT ATCTGTGTTG GTTTGTGTTG TGACCACTAG ATGTCCTCAC ACTACTTCGT 720
ATTGAAAAGC TTTGTTGAAG TAGAAAAGAT GCTTCGCCAT CAGTGTAAAT GAACACGTCT 780
TAAAGGTCCC TATTCAGCTA ATAACTTGTC TAAAAAAAAC TCTTGTGCAA TAGTTTTCTT 840
GATTTGTTTT TCTTTTTTAT TTATTTTCCA AACGATGTTT AACAGAGCAA GGGAATTGTC 900
ATGTTATGTC AGATGTTT 918