EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-03052 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr13:3000916-3001986 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr13:3001085-3001106AAACTAAAACCAAAACCAAAA-6.06
IRF1MA0050.2chr13:3001797-3001818CAAACGAAACAGAAACCAACC-6.07
IRF1MA0050.2chr13:3001079-3001100AAACTAAAACTAAAACCAAAA-6.68
IRF1MA0050.2chr13:3001073-3001094AAACCAAAACTAAAACTAAAA-6.71
IRF4MA1419.1chr13:3001800-3001815ACGAAACAGAAACCA+6.15
IRF9MA0653.1chr13:3001799-3001814AACGAAACAGAAACC+7.02
LHX2MA0700.1chr13:3000999-3001009ACTAATTAAC+6.02
RAXMA0718.1chr13:3001419-3001429GCCAATTAAC+6.02
RREB1MA0073.1chr13:3001747-3001767CAACCAACCAACCAAAACCA+6.19
RREB1MA0073.1chr13:3001116-3001136ACCCAAACCAAAACCAACCA+6.97
Enhancer Sequence
CAACCAACCA AACCAACAAA ACAACTAACT AACTAACTAA CTAACTAACT AACTAACTAA 60
CTAACTAACT AACTAACTAA CTAACTAATT AACCAAACCA AAACCAAGCA ATCAACAAAA 120
TAACCAAACA ACCAACTAAG ACCAACCAAC CAAATCAAAA CCAAAACTAA AACTAAAACC 180
AAAACCAAAA CCAACCAACC ACCCAAACCA AAACCAACCA GCCAACAAAA AAACTACCAA 240
ACCAAGACCA ACTAACCAAA CTAAGCCAAA ACTAACCGAC CAAACAAACC AAAAACAACC 300
AACCAACCGA ACTAAACTAA AACCAACCAA CCAACCAACC AACCAAACCA ACCAATCAAC 360
CAACCAACCA ACCAACCAAC CAACCAACCA ACCAAACCAA AAACAACCAA CTAACCAAAC 420
TAAACTAAAA CTAACCAAGC AAAAACACAA CCAAACCAAA ACAAACCAAC CAACCAATCC 480
AAAACCAAGC AACCAACTAA CTAGCCAATT AACCAGAACC AACCAACCAA ACTAAACTAA 540
ACCAACCAAG CTAAAAAACA ACCAAACAAA AACAAACCAA CCAACCAAAC AAAACTAAGC 600
AACCAACCAA CTAGCCAATG AACCAGAACT AACCAACCAA ACCAAGAACA AGCAACCAAC 660
CAACCAGCAA ACTTACCAAA ACCAACCAAC TAACCAAAAC CAAAAACAAC CAACTGACTA 720
AAACCAACCA ACCAGCCAAT CAACAAAAAC CAACCAAAAC CAACCAACCA ATCCCAAATC 780
AATCAACCAA CCAACCAACC AACGAACCAA CCAACCAACC AACCAACCAA CCAACCAACC 840
AACCAAAACC AACCAATCAA ACTAAACCTA ACCAAACAAA CCAAACGAAA CAGAAACCAA 900
CCAACAACTC AACTCTAAGC ACCACAGGCA AAAATCAACA GCGAAACAGG GTTATAACGT 960
ATGTTGCCAG ATTGAGGTAA AAATGCTTGG GGATTTGAAT ATTTTGTCAA TTGTGTGGTG 1020
ATGAGCTTCA TACAAGATCT GGCAACTTGT CAAACAAGGA CAAAATGTTT 1070