EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-02699 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr12:29009130-29009834 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr12:29009816-29009833CAGTGTTAATTAATACG-6.09
POU4F3MA0791.1chr12:29009424-29009440ATCATGAATAATTCAA-6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr12:29009386-29009403AGGTCACCGTAAGCTCA+6.02
Rarb(var.2)MA0858.1chr12:29009386-29009403AGGTCACCGTAAGCTCA+6.56
Enhancer Sequence
ACATGAACTC GTGACTCATG CTGTAGTTAA AGTTAATTCA TGATTGGCAT GCATTAATTC 60
ATCATTAGTT CATAATAAAG TAATGTTTAG TTAACATATT AATACATCAT TATTCATGTA 120
AAGTGTTACC CATGATGAAC AAGACATTAA GCAGCAGCAA AACTCTGTTG CTTTGTATTT 180
TGCTGCTTTC GGTTTGTATT TCTTAACGCA CTTCCGCGTT CGTTACTCTC TCGTCATGAT 240
CTTGGATGAT GAGGTAAGGT CACCGTAAGC TCAGCGTAGT GCTTCGGTCA CTGCATCATG 300
AATAATTCAA GTAAAACGTA GCTGTGGTGT CACGATGATT GTGTCTGTCG TAGCAGCTTG 360
TAATCCTTCT CGTGAATATT AATGTGGTGA TGCGCTCAAT CGTTTCGTTA CACAATGGCT 420
ACGTTGAGCC TACGTCATCT GCTCCACTTC CTTTAAAAGG AGCTCAACAT ATTTGGCAGC 480
AAGGAATAAA CTTATAAACC GTCCTTTTTA ATACGAGCTC TGTTAAACCG TCATGAAATG 540
CCCGCTATCC ATACTGTTCT CTCATCATAA CTTTTTAGCT CTGAAAAAAC GATTTCTTGT 600
CAAAATAAAA GTCCCCCATA AACAATAGAA ATAAAATGAT CCTTCAGCAT AAAGAAATGT 660
AAGATAACGC TTATTTACGT CTGTTACAGT GTTAATTAAT ACGT 704