EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-02657 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr12:27040570-27042263 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr12:27041097-27041114TCCTTTAATTAATTAAT-6.18
FOXE1MA1487.1chr12:27042246-27042261AATGTTTGTTTAATG-6.78
Foxd3MA0041.1chr12:27042245-27042257AAATGTTTGTTT+6.27
Lhx3MA0135.1chr12:27041102-27041115TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:27041103-27041116AATTAATTAATTT-6.92
POU4F1MA0790.1chr12:27041757-27041771CATCAATTATTCAT-7.14
POU4F2MA0683.1chr12:27041755-27041771CTCATCAATTATTCAT-7.65
POU4F3MA0791.1chr12:27041755-27041771CTCATCAATTATTCAT-7.97
POU6F1MA0628.1chr12:27041104-27041114ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:27041104-27041114ATTAATTAAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr12:27041419-27041431TGTAAAAAAAAA+6.07
ZNF384MA1125.1chr12:27042236-27042248TGTAAAAAAAAA+6.07
ZNF384MA1125.1chr12:27041422-27041434AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr12:27041425-27041437AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr12:27041302-27041314TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr12:27041421-27041433TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr12:27041303-27041315TTTTTTTTTATT-6.62
ZNF384MA1125.1chr12:27041120-27041132TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
CGAGAACATT TTGGATCTCA GTATAGATAT AATAGGCAAT ATTAAAACTA AGCTCTAGTG 60
TATCACAACA CAACAATTAC CCAACCTTTC AATTTACACG GTTAATGCTT AAATCGGATC 120
ACCAGAACGA TTTTACATGT TATTTTAACA TTCTGCCCTA TTTGTATGAA ACACAACAGA 180
TAAATCATCT TCCCCGATTA TTTTCTTCTG AAGTTCAGTC CATAACACCA ACATGTAGCA 240
CTTGGTAGCT CTAAAAAAGT CACGTGAGGT CCATAAAGTT AGTTTTATGG TTTTAGGGGG 300
GTTGAAAATG CGCTACATAA TTCACATTCT TGAATGTAAC TGACTGTTTA ACTGCTTCAG 360
CGGGATTCTA AAGGTTGTGG GCAGCATGCG GAGTCTTCTC AAACTGGACA GTCGTAATAT 420
CCCATGCTGA CTTTGCTGTC AACAATGATT TTCATAATAA TTCTGCTGGA TGTGAAAAGG 480
CAACACGTCT TCTCTGTAAG TCTCAAATTT CTTCTTTAAA TGCTCGTTCC TTTAATTAAT 540
TAATTTATAG TTTTTTTTTA AATGACAGAT AGGTTTACAT GATATCCCAA GGCTGGATAT 600
CCAGTGATCA AAATACAGTT GTAAATAATG GCGGATTTGA ACTCGAGCGA AAAGAGAAAG 660
AGAGAAAAAA ATGTAGAATA ATTGTGTTGC TACAAAAAAA ATTATTACGT GCAAAGTGAA 720
ATTTGGATAA AGTTTTTTTT TTATTGTGCG TGTATAATTG AATAAGTTCT ATTTCCTTTT 780
AAATGAACAC ATGCAGAAAT ACATTTTAAA TTATTTCATT CAAAACCCAA AACCTATTTC 840
TTAAAAAGAT GTAAAAAAAA AAAAAAAGAT AATAGCGGCA TTGAAGGTAA CGTGGTAAAA 900
TACGTTGGAA TTCCATGTTC AGTTGTGTAC TTGTATCATA AGATAGGAAA ATTATAGAGA 960
ATGTCTTTTC AGTTTGTACA TGCTTGTATG TTTGGACATT TGAAATAGGA GCAATATTTT 1020
GAGCATAAGA AAACTATGGT TGTGTTTTTG TTGAGGAAAA AAAGATACTT GAATGTAACT 1080
ACAATTTACT CGTGATAGAA ACGGTACTTC GATTCATAAC TATTAAAGTC CCATTTTGCC 1140
TCTATAATGC GTTTTGCATA TTGATAGGGT AATCTGGGCG CTGTTCTCAT CAATTATTCA 1200
TTGGGAAGGG ATCACTCGGA GGTCAGTAGA CGAAAGTGGC AAACATGCCT TCCCAAAGAA 1260
GCACAAGGTC CATGCCAAAC TAGCTGGATG GTGATTTTGA GATATATTTT GACTCAAAAG 1320
TCAGGACTGT AATTCTCCTA AAGATGGTTT TGTAAACTAT TGACACAACA TTGAGAAACA 1380
GTGCCTAGTG CCTGCAAGTA AACCAAACAG TCGACGCGAT GCTTAACATA TTAGATTACC 1440
TTTACCATTC TGCTGATAAT AATTTTGTTT TCATTGAATC ATAAATGTCT GAAATTTAGT 1500
TTTGTTGCCA GTTAGATTGA TGCAATGCTG CTTCATCACC AGCAGGGCCC GCCTCACACC 1560
GAGCTCCTGA TCTGTTATTT TCTCATTCTG CATACACACT TTATGTTTTC TTTGAAAAAG 1620
ATATAGATTA CATCTTAGGT AGAATTTTCC AAAACACGTA GAAAAATGTA AAAAAAAATG 1680
TTTGTTTAAT GTG 1693