EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-02655 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr12:27031885-27033323 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr12:27032239-27032250GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr12:27032239-27032250GTTTTATTGCC-6.62
HOXD9MA0913.2chr12:27032239-27032249GTTTTATTGC-6.02
Lhx3MA0135.1chr12:27032102-27032115AGTTAATTAATTC-6.15
USF2MA0526.2chr12:27032822-27032838GGAGGTCACGTGAGCA+6.32
YY1MA0095.2chr12:27032705-27032717AAAGATGGCGGC+6.22
Enhancer Sequence
TTCGTGTAGT TTTGTTTTGC TAAATGCAAA ATTAAGAATA GAAAAATAGC CTACTGATAA 60
ATATTATAAT AAAAGGAAAT TTTAAATAGT CTGTTAAACA GAATACAGCC TTCTTTACAG 120
ATTATAATTT TAAATACATG CTTGCTGAGT ATCTCAATAA ATGTAAAGAA ATACAATGCA 180
TATACATTGT CACTAAATGT GTTAAAATTT TATAAAAAGT TAATTAATTC AGAATATTAC 240
CTCTTGTGAT GCTTTTGGAG TCTTTTTGGA CAGCATGCAC TGCTGAGCTT CAAGAGCATT 300
GCCTTTTCGA GGGTATAACC CACAGACCAT GCTCGGTCAC TTTTGGGTTA TACTGTTTTA 360
TTGCCCCAAT AAATGTCGGA AATAAGTGTT TGTTCGTATA TACAGGAAGC AATTCTTTCC 420
TCCACGCATG TTTAGTGCTG TAAAAAGCTT TCACGTTCCA TTTGTCTATT TTTCTCTTAA 480
AGTCACATGA CAAAAGAACG CAGACTATTG AGAAACACGC AATTGTGCGG TTTTATTTTA 540
GGGTAATTGG TCTATTTCTG GTTAAATATA AACTGGTCAA AAGTATAGTA TCTCTGTATA 600
TAGGCTAGTT AGCATTTTAG ATAAAGGCCT ACACATTTTA ATTGTTTAGA AAGAACCAGT 660
GCAAAACATT TGTAGTGATT GACTATGGAC TATCTCTAAA TCTGATATCA AAAATTATAA 720
CCTTGGTTTT ACATTTTTAA AAAGAAATAA TGCTATCACA AGCTATAGCT GTCTTTGGAT 780
GTTAACGAAG TGATGTGCTT TTCCTCCTCT TTTAACGAAT AAAGATGGCG GCGACCGAGT 840
TACTGGTGAA GCAAAGCAAT AAACTCACAG CTGTTTATGA AAATTTACAA CTTTGTGATA 900
GAACTTTATG TGTGGTTCTG CCAGTGGATT GGCTGACGGA GGTCACGTGA GCAGCTCTCT 960
GTGAACATGA ACTTTTTATG ATTTCCCAAG TGGCTATAAT GCAGCATTCT TTTGGTCAGG 1020
GCGCAGTCAG TAGCACCTCT GTCCTTTATG TTTTTTACGT TTTGTTAAAG CAGAGAAAAA 1080
GGAAAATCTC TTGAGCTTGC CGAATAGTGT GCGTTAATAT GGATGGAAAG CTCGACGTCA 1140
CGCTAGGACG AAACGTCTTC AGATTTTCAC ATCAGTTAGG AGTGCAAGGG TCAAAATTCA 1200
CTGAGGACCT TAGTCCATTC TTCTCTAATT TATCAAGTTT TAGCTCTTCC TGCATCTCAC 1260
GTGCATCTAA TAATACGACA CGAGATCCTG GTTAATCGGC GAACCTGCTT GATTGTTTTG 1320
GATCATTCCA GTGAAGCAAT GATGACGGGG AAAAAAGGTA GGACTAGACC TATAGTCTTC 1380
TGTATTGCAC TGCACCGATG TCATGATGCA ACCCAATGTG GGCATATTTC ATTTAAAA 1438