EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-02565 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr12:23312890-23314116 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:23313794-23313806GATTGTTTGTTT+6.92
SOX15MA1152.1chr12:23313150-23313160AAAACAATAG-6.02
SOX15MA1152.1chr12:23313551-23313561AAAACAATAG-6.02
Sox3MA0514.1chr12:23312890-23312900CCTTTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
CCTTTGTTTT CATTTTCCTG GCTTATGCAT GAGCTAGTGA CATATCTCTG GCTAACACTT 60
TATTTTGAGG GTCCATTTGA GTATTAGTAG ACTGTCTGTT TAATATCTGT TGATACTGCT 120
CCTTCAACAG ACATTTAACT GACTATAAGA AACTTTGCAA GTACATGTCA ACTTACACTA 180
ACCCCAAAGT TAGTTGCCAT GTAGATGCAA TGTGACTTAA ATTTAACAGA CTATCAAAAT 240
AAAGTATGAC CTATCTCTGT AAAACAATAG CCTTTTGGTA TTTTTTTGTC ATATAGGTAC 300
CCTTTCGAAA GGGTACCCAA AAAGTGGTAT GGTACAGTTT GCTTTTTTGG TACGTTTTGA 360
CAGTGAAAAC GACCATTAAA GCATACTGTA CTGTACTGTA CCACTCACTG GAAACAAACC 420
AATTATTAAA AATAATCAAA TGATGTATTG GATATATTAT AAAATCACTT TAAATCACAA 480
AATGCTTCTG TGAATGGTAG AAAGGGAATA GGTTTATATA CAGGGGATGC AAAAAAGATT 540
GTAAAAAAAT AACAAAATGC AGATAGTTTT TTCACTGGAT CAGCTTACAA AATATTATAT 600
TACAAGCACA TATTTTCAAG TGATACTTTT CACATAAAGA CACGTTCATC AGGTTTGAAA 660
GAAAACAATA GATGTAGTGT TTAAAATTAA CAAACATGGA CTTTCTGTGG AAGTATCAGT 720
GGAACATGTG CAAAGCTAAT GTGATTAATG GCGCCTGTGA GAACATTTGG TTTAAAGGGA 780
TTGCAAAATC ATAGTATTGT TTAGGGCTGC ACAGGAGCGG AGTTAGTGAT TTGGGGGTCT 840
TAAGCAATTC CAGCCATTGG GCAGAAAATC CTAATAAACA CCCTTTGTAT TTTTATGTTT 900
GTTTGATTGT TTGTTTTGCT GACTTTTTCT TATATAACTC AGTCTATCCG ATTTTACTGC 960
TAAATTGCTT CATTATTGGG GGGTGGGGGA CAAATTTGCA CAGTCATATT AATTGTGATA 1020
CACGTATTTA TTAGACCCTC AACTTTACTA AATATGAGAG AAAGCGGTGT TATAAACAGT 1080
TGAAGACTGT ATTTGGCCCC CCTTTGAATT TATCTTTCTT TTTTTAAATA TTTCCCAAAT 1140
GATGTTTAAC AGAGCGAGGA AATTTTCACA GTTTGTCTGA TAGTATTTTT TCTTCTGGGG 1200
AAAGTCTAAT TTGTTTTATT TCGACT 1226