EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-02561 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr12:23254665-23255298 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RORA(var.2)MA0072.1chr12:23255118-23255132TTGACCTAGTTTTG-7.08
RORCMA1151.1chr12:23255119-23255131TGACCTAGTTTT-6.02
ZNF384MA1125.1chr12:23254885-23254897TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr12:23254884-23254896TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
GGGGAAGAGT TGGGTCACTA TAGAACAAAA ATCGCTGAAT TCATTTTACT TGACATTTTT 60
GCATTTAAAA GCTTGGTTAT GGATGTGACA TGAATTTGGC ACTTGTGACT TTAGTAAATC 120
AAATATAATT GTTTAAAAAC ATTGACAGAT ATTTGAGGTC TTTTTACAGC ACTGTAAAAT 180
ACAAGCCTAC ACAAACTTAG AAAGGGTTTT GGTGAAAACT TTTTTTTTTT ATGGCAAAGG 240
TGACTTGCAT GGAAATGCTC ATAGAATAAA AGCATTAAGA ATCATATCAG ATTGTTACCC 300
ACTGGATTTT AAATATGATG ACGCAAGTGA ATATCCACAA GCTTGTAAAG TTATTATTTC 360
TTTAAAGTCA TCTTAAACGT TATCATGCTT GGTGTGATGA ACCCATGTCA TTCCTATTCA 420
GTAAATCTTC TTTTATCTGT ACATTTAGAA ATCTTGACCT AGTTTTGATA CATATAAAGG 480
CAGTTCAGCT TAATCACAAA ATGCCAATTT GCAGCTCTTA TTTCGATAAG AAGATAACGG 540
GATTGCTTCT TCATAAATGT GTCTTCTAAT TGAACAGTCA CTGCATTCCA CAGTGGAATG 600
ATGAATAAAG CAGTTGTGGG AGCTTCAGAT CTC 633