EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-00674 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr1:50250811-50251405 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr1:50251053-50251068TGTGTTTGTTTAGTG-6.05
Foxj3MA0851.1chr1:50250839-50250856ATCAGATAAACAAACAC+6.12
KLF9MA1107.1chr1:50251321-50251334TGTGGGTGTGGGT-6.32
Enhancer Sequence
AGTCCCCAGT TCTCCCTCCT GCCTCAGTAT CAGATAAACA AACACTCAGG ATATCCTGAA 60
GAAACCGTAG TCTTAGCCAA AGGCTGTGTC CTAAATGGAG CGTCATTAAC TCCACTGAGC 120
CCTCCACGTT AGATATGCAG CTAATTAGAG GCCCATTCAG ATGTGAACCA CCGCAGACGC 180
TCTTACCTGA CAGACCGCTC TGCTCTTCAA ACTTCAGCGC TCTTGTTTTC TTTAGTGCCT 240
GTTGTGTTTG TTTAGTGTTT AGAGGGACGT CCGCTGAGAT GGGGCTGCTG ATTGACGTGT 300
GAATGTCCTG ATGGGGCTGA CAAAATGGGT GTCTTTTTTA TAATCAAATT GGACTTGAAA 360
TTACAGTAGT CCCAGAGAGA TGTTTTTAAT CGCTACGTCC AGATAGGATT TGGCGGAGCA 420
GCTCTCTGGA GAGTCACTGC ACCCCAGAGT CAACTTTAGT TAATGGTGTT AGCATAAGAT 480
GACTTAGTGT GAGATTAATT CATTAAGTAG TGTGGGTGTG GGTAGTAATG TGACACTGCA 540
CCGATTTGCT CCAACACTAA TTGTTGAGGC GGTTTAAAGT GATCTATAGG GAGC 594