EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-00672 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr1:50238493-50238912 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr1:50238769-50238779GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr1:50238769-50238779GCTAATTAGT-6.02
IRF1MA0050.2chr1:50238878-50238899GTCTAGTTTCATTTTTATTTT+7.63
LHX6MA0658.1chr1:50238769-50238779GCTAATTAGT-6.02
Enhancer Sequence
TTTTTAAAAA ATCTTCTCCA ATTAATATAT CAACACAGAT TTGTTAATTT TTATTTAAAG 60
GCACAGAGTC TGATTTATGC CTGTATTTTT TTCCTAATTG TCTTCAAGCG AGCGGCCTGT 120
AGTTCATTAT CAGTGGTCAG TCGGTGGTCT TTGTCCTCAG GCCAGGGCAG AGTATGGCCA 180
GTTTCATTAG CTGAATCTCG CCATTTGCAA TTCTCCCATT GTGCTCCTAA ACAATGGCGG 240
CAAACAAAGC ATTAAAATGG AAATGACTGT AATGTAGCTA ATTAGTTCTC CATGTTGGGC 300
TGTTAGCGGG GAGAGGGGCG GACAATTACA GAGAATTAAT CACACGTTTC AGATACACAC 360
TAACTTTTCT GCTCACGTCT TTCTGGTCTA GTTTCATTTT TATTTTTGTC GATTAGTAC 419