EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-00374 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr1:29066505-29067663 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PKNOX1MA0782.1chr1:29066629-29066641TGATAGCTGTCA-6.27
ZIC1MA0696.1chr1:29066706-29066720GCCCCCCTGCTGTG+6.87
ZIC3MA0697.1chr1:29066706-29066721GCCCCCCTGCTGTGT+6.68
ZIC4MA0751.1chr1:29066706-29066721GCCCCCCTGCTGTGT+6.51
Enhancer Sequence
CAACTTGGTA CTAATATCTA AATTAGACCC TAGTACACTT TTACAAGCAT TGCAAGATAA 60
GCACGAAGCT TTTGCTCTTC TCACCTTTAT CTTTTCATGG AGTGTAATCC TCTGTTCCCA 120
TGATTGATAG CTGTCAGTTT TCTCCCCCTC CTATTCCATA TGCATGAGAA TTTGATAGAG 180
GCAGTGTTTT AAACTCTGTT CGCCCCCCTG CTGTGTTCTG TGCTGGATTG GGGGAATGAA 240
GAGGGGGGGT AGAGGTGGGG ATCTTTTGCA TTTGATTTGC AGCCGCCAAA GAGCATCTAA 300
ATGAAGATGT TTAAACAGAG CAGTGGGGGA TAATCTGGAC TCTGTATGGG GGAACAAATT 360
GACATTAGAA GTCCGTATAC TGACCCCAGG ATTGGTGTTG TCAAATATTT TACTCACAGA 420
ATGCTTCTTT TAACCCTCAT TGGACTTTTT ACACCTTGTA GTGGCATTTC CTTAAACTTG 480
AATTGGAAAT GCATTTACTA ATTTGGCATT TGTATAAAAG CATTTCTTTA AAAGTAAGCC 540
ACAGGCTATG TCTTTGGTTA ACTGTGTAGG AAATCAAAGT TTATTATCCT CCCGAAAACA 600
AATGGTGGGA AGCTGTCAAG TTTTGCAGTG CATTAAGCTT CTCAGACAGA AAGCTCGTTA 660
AACACACAGA CAATAAAAAC ACGTCTCTAT CCGTCTCTGC GATTCAAAAC ATTAAAACAA 720
AAATAAACAA GAACTAATTC ATGACCAGTT TTCAAATTAG CGGTAAAATA AGGTTAAAGT 780
TTACTGTTAA CATGTTTTAA TAGTGTATTA TGGGCTCGCT TGTTTGTGTT GCAACTGTGC 840
ACCATTTTCG CGCAAGCTCC TGTTTACGTC AAGCTCGTTA AAAGTGAGTG AAAACGACTC 900
TGCGTCTCCC TTTTTACACA TGTGTGGAAA ACATTAGCAG AGAAGCAGCA GTTGGCTAGC 960
GAGTCTTTTC CAAACCTCCC CTGTTGATGC AGTTGTCAAT ATTAATGCTT CCCCATTGTG 1020
AGGTCTGTCA CTCCGTCAGC TCACTGTCAC AGTTGCTTCA CACCGTGTGT GACGACATCT 1080
TGGCCACACA GGCAATGGAT TTGAGAGGAA CTGACTGGTA GCAATAAAAA TGAGTGCGTT 1140
TCAAATTTCA GAATCTGG 1158