EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-00113 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr1:8477791-8479617 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR1MA0112.3chr1:8478670-8478687AAGGTCAAGATGATCTG+6.54
Foxj3MA0851.1chr1:8478254-8478271CTGAGGTAAACAAAGCA+6.03
ZNF384MA1125.1chr1:8478037-8478049TTTTTTTTTATC-6.02
Enhancer Sequence
ATTTATTTGC TGAATAATAT AAAGCTGAAG TAGTTCCAGG CAGATCCCGA TCGCATTTCA 60
ATTTCATATC ATGAAGCGGT TCAATTTCAG TCAACAAAAG CAAAAAGCTC AGAGAGATAT 120
GTAAGAAATG AATACTATAC CAACACTGGA GCTGTATGAG GACCAAAACC TGACAAATTT 180
CCTGAAATAA GTCATCTAAA CCAGGAACTT CCAAATTCTG AAAGGCAAAT TCTTTTAATT 240
AAACTGTTTT TTTTTATCCA AAATCTACAA AAGAAAAAAA AATAGTACTT ATTAGTTGCA 300
TTATAAAAAC AGGCTATTTT TTTTCTCCAT TGGATTACAA CCTATTTACT AAATGCTAAT 360
GTAAGAAACT AAAACATTAT TCATAATCTA AATGCAGTCT ATTAAATCTA GCTAATTCAG 420
TCTGGCACCT AAAGAACTGC AGAAATAAGT GTTGCCTTGG TTACTGAGGT AAACAAAGCA 480
GCATAATGTC AAATCACGTG AAGGTGCGCG TTTACAACAG CCATTACGGT GTTTCCATTA 540
GAGCGAGCAG CACAACAGGC CAATGTCAAG CTAGTAGGTT GTAGTTTTAT TTTGCCCCAC 600
AAAAGTGTTC TTGGAGCTTC GTTTGGTTTT ATTTGAACCA CTGAAGTATC ATGGAGTGCC 660
CTGACAACAT TGTGTTTGGC ACCTTTTCTG CTCTTCGAAT GCCTTGAGAC CCTTGCTGTT 720
TATGGAGGAT AAGGGAGCTC TCGGATTTCA CCTGAAGTAT CTTAATTTTT GTCTCCCGAA 780
GACGAACGAA GGTCTCGGGG AATTGAAACA ACATGAGGGT GAGTGATTAA TCTCAGCCAA 840
TCACATGACA GCAACTTAAT TCTTTGTAGG CCTGTAGACA AGGTCAAGAT GATCTGCTGC 900
AGTTCAAACC GAGCATCAGA AATGGGAAGA AAGGGGATAT AAGTGACTTT GAATGTGGCA 960
TTTGGGTTGG TGCCAGACGG GCTGATCTAA GTATTTTAGA AACTGCTGAT CTACTGGGAT 1020
TTTTACGCAC AACCATCTCT AGGCTTTACA AAGAATGGTA TGAAAAAAGA GAAAATATCC 1080
AGAGAGCAGC AGTTCTGTGG GCGCAAATGC CTAGTTGGTG CCAGAGGTCA GAGGAGAATG 1140
GCCAGACTGG TTCGAGATGA TAGTAAGGCA ACAGTAACTC AAATAACCAC TTGTTACAAC 1200
CAAGGTATGC AGAAGAGCAT CTCTGAACAC ACAACACGTC CAACCTTGAG GCAGATGGGC 1260
TACAGCAGCA GTAGACCACA CCAGTTGAAA CTCCTGTCAG CTAAGAACAG GAAACTAAAG 1320
CTACAATTCA CACAGGCTCA CCAAAATCAG ACAAGAAATG ATTGGAAAAA TTGTTTTCTA 1380
GTCTGATGAG TCTCGATTTC TGCTGTGACA TTTGGATGGT AGATTCAGAA TTTGCCGTCA 1440
ACACATGAAA GCATGCATCT ATCCTGCCTT GTATCACCGG TTCAGGCTTC TGGTGGTGGT 1500
GTAATGGTGT TGAGGATATT TTCTTTCAGT TTTCTAGAGC ATCTTTGAAA TGTGGTGGAG 1560
GAGATTCGCA TCATGGATGT GCAGCTGACA AATCCGCAGC AACTGTGTGA TGCTATCATG 1620
TCATGGACCA AAATCTCTGA GGAATATTTC CAGTACCTTG TTAAATCTAT GCCATGAAGG 1680
ATTAAGGCAG TTCTGAAGGC AAAAAGTGGG TTCAACCTGG TTCTATTAAG GTGTACCTAA 1740
TAATGTGGCC GGGGAGTGTA TAATCTTGAT TTTGTGTTTG CCATTTTCTT GTCAACAATC 1800
AAGAAATGAT TTAAACTAAC TTCATT 1826