EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-00087 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr1:6851225-6852914 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr1:6851828-6851840ATGTAAACAGAT+6.62
FOXP2MA0593.1chr1:6851828-6851839ATGTAAACAGA+6.02
IKZF1MA1508.1chr1:6852222-6852234GAAACAGGAAGC+6.92
Enhancer Sequence
GTTGGAAGGG CCCTTTAAGA GGGAATGGTC CAATCTCTGC TTTAAACGAG TTACATTCAT 60
GTACTGTTAA AGCACGTTGA ATGTTTGTCT CTGTGCCATT TGGGTGTTTC ATAATCTTTA 120
AAGCTGAAAC AGGCACCTTT TGCAGAGATA TGTCATCAGC TTTCTCTGAT TCTGAAGTCA 180
TATGCTTGTT AGCTTTTGTG TTTCTGACAG GCATTAGTTT TTGCACAATC AATTTGTTTT 240
TCAAATCTTC AATTATGTCC ATGTATTTCT CACATCTTTT AGCCAATGCT AATTGATCTT 300
CTAGTAGTTT GTCTAGCTGT GATTGGAGAT GTTCAATTTT TTCCTGAGAC TTTAGTGCTT 360
CAGAATCTGC TGTGACCAGT TGTTCAGTTT TCTCCTTTAA ATTTGCAAAC ACCTTTTTTA 420
GGTTATTGCG TATGCTAGAG GCATTCAGGT AATTTAAAGC CTCAATGATT TCTTTGTGTT 480
TACATTTCTT TTGTTTGATG CCCACTGTTT TCCACCATAT GGAAATGTCC TCACTAGTAG 540
CGTCCAAATC AAGGCCTTTT CTAGTGAGTT TGTACAGTAC AGGCTCAACA TTTTCAGTCC 600
ATAATGTAAA CAGATCATAC TCATTATAAG TATTCCACTC CATATTGGAG GACATTTACT 660
TGGATTTCAC AGTGAGATGA TTATCTAGAT TATTCTGATA CTTCTAATTC CTGTTTCACA 720
CAATTCATGC AAATGGAGAC TTTCCCTACC ATGCCATGAA GCAATGAAAA CAGACTTACC 780
CACTCTGTGG TTAGAAGTTC AGCTTTAATC CACTCAGAAG AGTTCTCATT CTGATGACCA 840
TCGTGTGTCC AAGAGTAAAA TAATCCATTT CCAGGATAAG CAAAAAGATG TTGATACAAA 900
AAGTATCTTG CGATTAAAAC TCGCCAAAAT TATATCGCGT CGGGTTCGCC AAATTGTAAG 960
GCTTGAAGCT TACGCTGCTA TTCTGAACCA ATAATCGGAA ACAGGAAGCA GTTGAAGGAT 1020
GGCGTGTTTA AATCCATTAT TTATCTGACT CCATTGTAAT TAATCTGACT CCATTAAAGT 1080
TGTTATCATC ATTGATAAAG AGAAAGAATC TCTACGTCTT AAAGCAGGCA AAGTTGTTTA 1140
TTAAGTTACA TGATCAAATA TACAGACATT AGAATGACAC AAACTAACAT ACTGTATAAA 1200
GAAATTAGCT GTAACGTATG CACTGCTGAG CAACAAAGAC AGTGAAACTG CCTTTGTTAG 1260
CATACGAGGC TACGCACTGG TGTGCGGGAG ATGCAGAGTA AAAGCCATTC TCCCAGATCA 1320
ACAGTTACCT TTCCCTATTA TACCCTGAGC AAAGCATTGT CAAACATGAG TGAAAACCAA 1380
CCCCCAAAAC CAGATGAACA TGAGAACAAA GTTGAAGAGA TGAAGTGGGG GAGAAGTACA 1440
TTAACATACT CTCCTCAGGC CATGACCCAA CAATAGTAAA TATATTGTAG ATTGAAACAC 1500
AATTAATCAA TGTCTCTGTT GATTTCATCA CTACAACACT GAAGTCATAA ACTGTCAAAT 1560
AACACCAAAC ATGACAAAGT TATCTGAAAG AAGAACACAA GCAGATGAAT TGTGTATGGT 1620
GAAGAGCACA TGGTTGCTGT AAGCAAATGG CAGAGATGTG TATCGGAGCT GTGAGGAACT 1680
CTGCCTCAC 1689