EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR009-00002 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_bud 
Coordinate
chr1:4465-6623 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr1:5604-5616AAACATATGCTG+6.04
Myod1MA0499.1chr1:5804-5817AGCAGCTGTTTCC+6.14
PAX9MA0781.1chr1:5741-5758CGTCACACATGACTGAT+6.26
RFX1MA0509.2chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT+6.31
RFX1MA0509.2chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT-6.31
RFX2MA0600.2chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT-6.33
RFX2MA0600.2chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT+6.5
RFX3MA0798.1chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT+6.3
RFX3MA0798.1chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT-6.46
RFX4MA0799.1chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT+6.32
RFX4MA0799.1chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT-6.42
RFX5MA0510.2chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT-6.16
RFX5MA0510.2chr1:5928-5944TGTTGCCATGGTGACT+6.34
Enhancer Sequence
CATTTAACAA CTTAAATCAG TGGAGCTTCA CTCATTACTG AGCTCAGACT TTTCTGTCAT 60
GTGGACAAAA CTCTTCATGG AGTTGCTGTT GTTCAGTTGG TCACCATGAT GGAGGTCAGC 120
GTCTGCTTTA GTTGGCCTCT TCAGCTGCTT ACTTCAACAC TAGATTTATT TAGGTAGCCA 180
TAAGTCGGTG TGTTGATCAC ACAATTTGTA TGGCACGAGA AGCCTAAAGG AAATTTAGGA 240
ATAAATGTAA TGAGGTTATT CACTTCTATA GACTCTTACT GTACACTCTA AAAAAGCTGC 300
TGAATAACAC CAAAAGTGGT TCTTTGGCTC GTAATGAAAG GGCAACCGGG TGCTTTATAG 360
CAACTTAAGA GATAGATGCT ATATAGTACT TTTTATAGAA ACTTTTTGGT GCCATATAGC 420
ACCTACATTG TTAAAATAAT AATAATAAAT GGGCATTTTT TTCGTGATTT TGTGGGAAAA 480
TACCAGCAGC TCTGGTTTTC AGTAAACAAA ACAACAAACA TAAACATTTT TTTAGCAATC 540
CTCGATTATA AGTAACTTAT CTGCAGCTGT GCTTCCGTTT CTTGGGCACT CAGTAGTGTG 600
GACACTTAAG TGTTCATTTA AAACTGAGCA TTTGGCTGTG GGGTTAAAGG GTTAAACCTT 660
CTCCACTTGA TTAATCTTAT TATAGTCTGG TTCTGGATTG GATTTATACA GATTTGCCTG 720
TATGTCACAT CTTCTGCTCC AGCAGTTGGC TTTACAGCAG CACTTCTCAT GTATGCAGCC 780
TTGCTCAGCG AGAAGCTTCA ACATTTAGTT GTGCTCAGGT GTGAATGCTG TTTTCTGTTT 840
CAAATATGCT GTGATAAACA CATTTTATAA TTATTAAAGT TATATTGCGG TGAAGCAGAG 900
GGTAACTCTG TCGCCTCACA GCAAGAGGGT CGCAGGCTTG AGTCTCGGTT GGGTCAGTTG 960
GTGTTTCTGT GTGGAGTTTG CATGTTCTCC CCGTGTTGGT GTGTGGTTTC CTCCTGTTTC 1020
CCCCACAGTC CAAACACATG CGCTATAGGG AAACTGATCA ACTAAACTGG CCGTAGTGTA 1080
TGAGTGTGTA TGGGTGTTTC CCAGTACTGG GTTGCAGCTG GAAGGGCATC CACTTTATCA 1140
AACATATGCT GGATAAGTTG GCAGTTCATT CCGCTGTGGT GGCCCCTGAT GAATAAAAGA 1200
ACTACGCTGA AAACAAAATG AATTAACTCT AAGATTACAG CCAGTTCCCC ATTTTATCAA 1260
GTGAAAAGGT AATAAACGTC ACACATGACT GATTTTATCC TACTTAAATG TTTGAAATGT 1320
AATGTTGTGC ATTACCTTGA GCAGCTGTTT CCCCATGCCG TGTGTCTGCC TGATGCAGTG 1380
GTGTTGCTGC TTATGTCTGC TGTACCTCTG CATAAGCACA TCACGTTCAG CTGGAGACAG 1440
AAATGCTGAT CTCTTCATTC AGATGTTGCC ATGGTGACTC TTCATATCTG CGCTCCGTCA 1500
GTAATGCCTC TCGATAGCTG CGGTGTGCGC GCTTAACTCT GATTCAGTCT ACTCAGACTT 1560
GATTGACCCA TCACAGAGCT CAAGTTTAAA CTGAGTTTGT TGAACCTCCT TACTGAAACA 1620
GGCCCCAGAT CTATTGAGGC GCCGTCTGAA CAATGCAGGT TAGTTCCCTC TTGACCATCT 1680
CTAGTGTCTG TACAGCTCTG AGCACCGCAT TCAGCATTGA GTAAAGCACA TAGAGCGTAC 1740
TGGACACTTT AAACGTATTA AATGACTGAT TATTTTCATA ATTATGGGAT AAAAACACAG 1800
AGAGAGAGAG AGAGTCTCCT GCAGCAGACA CAGACAAAGC TGCACTCCAG TAAAAGAGCA 1860
ACTGTACCCT GACACGAGCA GACGCCGCTG GATTGAACAC ACATCAGAAC ATTTACTGCA 1920
AATAGACTTA AGATGTCTGC GAGCCCAAAC CCTGATCAAC TCAGCAGCAG GTTCAGAACA 1980
GCCGCTCTGT TTACAGTTAG AGTCGAACAC TTCCAAACAA CAACAACAAC AACAACAACA 2040
ACAATCAGCG GAGTAAGCCA CATCCACAGC TGCAGCCGCA CACAGGCCCT GACCACTGAA 2100
GCGGACAGGG AACAGTGTTC TGATAAACAC ACAGCATTAC TGATCCGGCT AAACACAC 2158