EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-15568 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr9:50608738-50610007 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr9:50609028-50609043TTTGTTTGTTTTGGC-6.19
Foxd3MA0041.1chr9:50609023-50609035GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:50609027-50609039GTTTGTTTGTTT+6.32
Hmx1MA0896.1chr9:50609657-50609674CTTGTTTAATTGCTTGC-6.67
Hmx2MA0897.1chr9:50609657-50609674CTTGTTTAATTGCTTGC-6.57
Hmx3MA0898.1chr9:50609657-50609674CTTGTTTAATTGCTTGC-6.91
Enhancer Sequence
CCACCAGATG CCACTGTAGT TCACCAGCAA CTCCCAGCGA ACTACAGTGG CTTAAGAACT 60
ACATATCCAT ACATTCTTTC GCGCACACAC CCGGTCTTTC ATATACACTC ATTTGCAACC 120
ACAGCTGTCT CTGTTCACCG TTGATTACCT GGACTATATA TTAAGTCATT CATCCTCTGT 180
TCATCAGTTC GTCGTTTGTC TTTGTTGGTA TGTGTTCCTG AACCTAGTTT TATATCCTGT 240
CATAGTCGCT GAGTCTAGTT AAAGTTTAAT CTGTTTTAGT TCCTTGTTTG TTTGTTTGTT 300
TTGGCACTTT GTTACTTTGA TTTTTGGATT TTTGTCACTG TCACTGCACA ATAGTCATTA 360
AAATCTGCAC TTGGATTCTA CACTTGTTTT TGTTCCCGTT TTCAATCCCG TACCGTGACA 420
GTCTGGCCAT TCTCCTCTGG CATCAACAAG GCATTTGCGC CCACAGAACT GCCACTCAAT 480
GGATATTTTC TCTTTCTCAG ACCATTCTCT GTAAACCCTA GAGATGGTTA TGCGTGAAAA 540
TCCCAGTAGA TCAGCAGTTT CTGAAATACT CAGACCAGCA TGTCTGGCAC CAACAACTGT 600
GTCACGTTCA AAGTCACTTA AATCCCCTTT CTTCCTCATT CTGATGCTCA GTTTGAACTC 660
CTAAATGCAT TGGGTTGCTG CCATGTGATT GGCTGATTAG AAATTTACTT TAATGAGCAG 720
TTGGACAGAT GAGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATAAATAAAA TGTAGATATG 780
CTTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTCTTGT CCCAAGTGGC CTCCCAAAGC AGTGACCCCC 840
TCTCTCTCTC TCTCTCTCTT TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCCACCCT 900
GACCTGTCGG GGTCTTGCAC TTGTTTAATT GCTTGCTGGG ATTTCAGTGG AGGGCAGTGG 960
CCTGTCAACA CTGTGTGAAT AGGTAGGTGG GGCAAATCTT GTGACTTTTC TGATCCCTCC 1020
CCCTTCGGTG AGTGTGTATA AGTGTGTGTG TGCGCACAAG ACAAGCGGCA CTCACCCCCG 1080
CTGGATAAAC GCTGGCAGGT GATTGGACAG AGCCATGATG ACTCTCTCTC TTTCTCTCTC 1140
TCTCTAATTA CCTCATTTGA GCTGGGCTGC AGACATACAC ACACACACAC ACACATACAC 1200
ATACAGACAG AAGAAGAAGC TTGCTGCGTT CATGTTTTAT ATTCCTGCAT CTCTTGAGAA 1260
ATGCTGTGC 1269