EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-15565 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr9:50142699-50143387 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:50142785-50142797AAATGTTTGTTT+6.27
Hmx2MA0897.1chr9:50142883-50142900AAGCCTTAATTGGTTGT-6.34
NFYAMA0060.3chr9:50143287-50143298TCTGATTGGTC-6.14
NFYAMA0060.3chr9:50143348-50143359TCTGATTGGTC-6.14
NFYAMA0060.3chr9:50143166-50143177TCTGATTGGCT-6.32
NFYAMA0060.3chr9:50142970-50142981AACCAATCAGA+6.62
NFYAMA0060.3chr9:50142857-50142868TCTGATTGGTT-6.62
NFYAMA0060.3chr9:50142922-50142933TCTGATTGGTT-6.62
NFYAMA0060.3chr9:50143048-50143059TCTGATTGGTT-6.62
NFYAMA0060.3chr9:50143194-50143205TCTGATTGGTT-6.62
NFYAMA0060.3chr9:50143255-50143266TCTGATTGGTT-6.62
NFYBMA0502.1chr9:50142858-50142873CTGATTGGTTGATAG-6.39
NFYBMA0502.1chr9:50143049-50143064CTGATTGGTTGATAG-6.39
NFYBMA0502.1chr9:50142965-50142980CCATCAACCAATCAG+6.63
Enhancer Sequence
GGAAGGTTGG TGGCAGTAAC AAAAGAGTTT TGATTGGTTG TTAGACAGTT ACTAGAGTGT 60
TTTGATTGGT TGATTTTGAG TTATAAAAAT GTTTGTTTAT AAGTGTTTGC CAGTAGCTAT 120
TAGAGTATTG ATTTGTTTTT AGGCAGTTAC TTCAGTGCTC TGATTGGTTG ATAGTCATTA 180
AGTAAAGCCT TAATTGGTTG TTGCTATGCA GTTACTAGAA TGTTCTGATT GGTTGTTAGA 240
AACACCTTGG GCTTTAATGT TACATCCCAT CAACCAATCA GAACACTCTA CTAATTATTT 300
AAAAACACCT TGGGCATTAA AGTAACATCC TAAGTAGTTA CTAGAGTGTT CTGATTGGTT 360
GATAGGGGGT TATTACAATG TACTGATTGG CTGATAAGGT TCCGATTTGT TGAAAGTTAC 420
TAATGATGTT ACTAATGTTT AGAGTGTTTA TTGGAATCTA CTTCAATTCT GATTGGCTAC 480
TAGTTACTAG AGTGTTCTGA TTGGTTGTTA GGAAATTACT AGAATGCTCA AGGTGTTTCT 540
AGTAATTCTC TAATGTTCTG ATTGGTTATT AAACAGTTGC TAGAGTGTTC TGATTGGTCG 600
TTAGTAAGTG ACTAGAATGC TCAGTGTGTT TATATGAATC CACTTGTGTT CTGATTGGTC 660
ACTAGACAGT TACTAGAGTG TTCTGATT 688