EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-15131 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr9:5589198-5590487 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr9:5589332-5589351GATCCACTAGAGGGCACTA+6.57
ZNF24MA1124.1chr9:5589551-5589564GAATGAATAAATG-6.48
ZNF24MA1124.1chr9:5589555-5589568GAATAAATGAATG-6.5
ZNF24MA1124.1chr9:5590273-5590286CATTCATTCATTT+7.34
Enhancer Sequence
TAGGGGGTAG TGAATATAGG AGGGTATGGG CTGTGGTTTT CGATACTAAC AGAGTTTACC 60
TTAATTTTAG ACTGGTTACA TTGGTCACAT ATTATCTTAT GACAACACGC GCAACAAGAC 120
TGTCGATATT TTTAGATCCA CTAGAGGGCA CTAAACTTAA CTAACGTAAC TATAGGTCGT 180
AATAAGCTGC TAGCTTGCAC AAACAACCAA TTTGGTTGTT GTTTAAGATA GCAAAGCTCA 240
AATATTCCCT TTCAGAACGA AACGATATCC CACATAACGA AGATATAATT GCCGATAATC 300
CAGCACTCAA ACCACAGATT AGGACTATAG AAGGAAGGCA TGGCTGACTA AACGAATGAA 360
TAAATGAATG AGAGAGACAT TTCTGGCGGT GAGGAATTGA GTGCGCTTTA CACGCCGTCA 420
ATAAAAGCAG CCACTGCGCG CTCCAGCTCA CTGCACCAGC TTCGGAGAAG GAGGCATTTA 480
GCATTGAAAC AGTCATAATG GCTGGTCACA CTCTCACGCT GTTTTCCTTA ATCTCATTCT 540
GCTCCGTAAT CCGTTTGACA CGCCGGCCCA GCGGCAGAAT TCAGCCACAA ATGAGCAGAG 600
TATGGTGGGA AGATAAAGCG TCGTCTCCAG CCTCAGACGG GCGAGAGAGG AGAGCTGTGG 660
AGGAAAAAGA CTGGCGCACA ACGACACGTG CGAGGAGGAG TCAACAGGAA ATGACATGAT 720
TACTGGTAAT GTCAACAGGA GGCAACGGCA GAACAGAAGC GACACTCTGC CGGTGCCGAA 780
GACAGACAGT AATGAGGCCA TTTTATGTAA GCAGAAAGCA GAATGTATGT AAATGCTTGC 840
AGCATGAACA CAACGGTATA AAGAAACAGC TGTGGGGGCT TATGATCCAG TCGGCAACCT 900
GCATTATGGG TAAATTGCTT GCCAAAATGC AAGCAGTATT TGCTGTACAT CAGAAAGTCA 960
GCGCTCAATT TCAATCATTG TGTGAGGGGG ACATATAAAG GCAAGGGCCC ATGAAAAGCG 1020
CTCAGTGACT TTGTTTTCAT GAACAGCCTA CATAAACAGA TGCCTTCTAA GGAAGCATTC 1080
ATTCATTTTC CTTCGACTTA GTCTCTATTT CAGAGGTTGC CACCGTGAAA TGAACGACCA 1140
ACTATTCCTG CAGATGAGCA GCAGATGCCC TTCCAGCCAC AGCCCAGTAT TGGGAAACAC 1200
CCATACACAC TCATTCACAC ACACTCTCAT ATGGGATAAT AAAGTTGAGA CTGATGTCTT 1260
TTGACTGTGA GGTAAACCGG AGCGCTAAG 1289