EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-15130 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr9:5560766-5562207 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SOX21MA0866.1chr9:5561894-5561909AACACTGCCATTGTG-6.82
Sox1MA0870.1chr9:5561894-5561909AACACTGCCATTGTG+6.16
Sox1MA0870.1chr9:5561894-5561909AACACTGCCATTGTG-6.25
Enhancer Sequence
TCTCACATTT ACCGATGACA TTTTAAAACC ACTCTTCCGG AATGTTTATA CGGCCTTTCA 60
ATAAACGGCC AAAAAAGAAA TCAGGCCGAG AAAGAGGTAA CCTTGCTTTA AGCAATTCTA 120
AATATAAAGT ATTGATTACG TTCCAGGTGC CTTTGCAACA CGACTCGCTG ACAAAACCAT 180
GCTGCAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 240
TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GAGAGATAGA 300
GAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAAACA GGCAGACCGA CAGACAGACA GACAGACAGA 360
CAGACAGACA GACAGACAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 420
TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 480
TAAACAGGCA GACCGACAGA CAGACAGATA GATAGACAGA CAGACAGACA GACAGACAGA 540
CAGACAGACA GACAGACAGA CAGACAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 600
TAGATAGATA GATAGATAGA GAGACAGAGA GAGACAGACA GACAGACAGA CAGACAGACA 660
GAGAGAGAGA GAGAGACAGA CAGACAGACA GACAGACAGA CAGACAGACA GACAGATAGA 720
TAGATAGACA GACAGACAGA CAGACAGACA GACAGACAGA CAGAGAAAGA GAGAGAGATA 780
CATAGATAGA CAGACGGACA GACAGACAGA TAAATAGATA GATCATTAAA GGGATACTTC 840
AGCCAAAAAA AATATCCATA TATATAATAA TTCCATCTTC CACTTGTGAC AAATCACTTA 900
AATTTTTTTT TGTCTTTGAA CACAAAAGAA GATATTTTGA AGAATGTTCA AAACTGGTCA 960
CCATTGACTT CTATTGTATT TTGTTTCCTT CTATTGATGT CAGTGGTAAC ATTCTTCAGT 1020
ATATCTTCTT TTGCATTCAA CAGAAGAAAA AAAACAAACA GATTTTGCAC ATGTGGAGAA 1080
TGCGTAACTG CTGGCAGAAT TCAAATGTAT GGGGTTACAA TCTCGTCAAA CACTGCCATT 1140
GTGTTTAAAA GGATACTTCC CCCAAAAAAT GACTATTTGG TCATATTCTA TTGCATCTCT 1200
GGAAGTCTTT TTTGTAACAG GTCGAAAATA TTTTTGATCT GTGTGTCACA AAGCAATTTT 1260
AGTCATCTTC AAATGATAAA GAACTGGCTC AGAGTTAAGG GAGAGCTCAG GGAAAGCCAG 1320
ATTATGTTTA TTAGATTTAG TGCTGCAGAG CTATGATTTG CTTTTCTGCT CTCTCTCTCT 1380
CTCTCTCTCT CTCCGCAGTG TGTGCTGCAG CAGACACATG ACAAATGGCC TAAGAGACAA 1440
G 1441