EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-15111 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr9:3765171-3766938 
TF binding sites/motifs
Number: 27             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:3765451-3765463GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765455-3765467GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765459-3765471GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765463-3765475GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765467-3765479GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765471-3765483GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765475-3765487GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765479-3765491GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765483-3765495GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765487-3765499GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:3765491-3765503GTTTGTTTGTTT+6.32
Hmx2MA0897.1chr9:3765834-3765851ATCGTTTAATTGTTTGA-6.16
Hmx2MA0897.1chr9:3766031-3766048ATCGTTTAATTGTTTGA-6.16
Hmx3MA0898.1chr9:3765834-3765851ATCGTTTAATTGTTTGA-6.15
Hmx3MA0898.1chr9:3766031-3766048ATCGTTTAATTGTTTGA-6.15
NFYBMA0502.1chr9:3766272-3766287CTGATTGGTTGGCTG-6.02
NFYBMA0502.1chr9:3765549-3765564CTGATTGGTTGGTTG-6.8
NFYBMA0502.1chr9:3765879-3765894CTGATTGGTTGGTTG-6.8
NFYBMA0502.1chr9:3766076-3766091CTGATTGGTTGGTTG-6.8
NFYBMA0502.1chr9:3765429-3765444CTGATTGGTTGGTTC-7.05
NFYBMA0502.1chr9:3765752-3765767CTGATTGGTTGATTG-7.19
PBX1MA0070.1chr9:3765500-3765512TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr9:3765615-3765627TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr9:3765826-3765838TTTGATTGATCG-6.18
PBX1MA0070.1chr9:3766023-3766035TTTGATTGATCG-6.18
ZNF384MA1125.1chr9:3766460-3766472ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr9:3766459-3766471AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
TCGGTAGAGC TACCCATCAA TGAATTTGCA ATTTAGTGTT TGGACTCTCA GTAATGATTT 60
AAACCACACT GAACTGAGCT AAACTGAACT GAACCTAAAC AATCAAAACT GAACTACCCT 120
GTTCCAGTTA CTATGACCAT TTATGTGAAG CTGCTTTGAC ACAATCTACA TTGTAAAAGC 180
CCTATACTAT TAAAGCTGAA GTGAATTAAA TTGAATTGAT TGATTCATTG ATTGGCTGAT 240
TGATTGGCTG AAAAACAACT GATTGGTTGG TTCATTGGTT GTTTGTTTGT TTGTTTGTTT 300
GTTTGTTTGT TTGTTTGTTT GTTTGTTTGT TTGATTGATT GATTGATTGA ATAGTTGGTT 360
GGTCGGTCGG TTCATTGGCT GATTGGTTGG TTGGTTGGCT GATTGACTGA AAAATGATTG 420
ATTGGTTGGT TCATTTGTTG TTTTTTTGAT TGATTGATTG ATTTAGTTGG TTGGCTGGTT 480
CATTGGTTGG CTGATTGGCT CGTTAGCTAA AATAAGATTG ATTGGTTTGT TTATTAGTTG 540
TTTGATTGGT TGATAGATTA ATTAGTTGGT TGGTTCCTTG ACTGATTGGT TGATTGTTTG 600
GCTGAAAAAT TATTGATTGG TTGGTTCATT GATTGATTGA TTGATTTGTT GGTTGTTTGA 660
TTGATCGTTT AATTGTTTGA TTAAATGATT AATCGGATGC TTCATTGGCT GATTGGTTGG 720
TTGGTTCAAA ATTGATTGAT TGATTGATAG CTTGATTGAT TGATTGATTG ATTGGCTGAT 780
AAGTTGGTTC TCTGAAAAAT ATTGATTGGT TGGTTCATTG ATTGATTGAT TGATTGGTTG 840
GTTTATTGGT TGTTTGATTG ATCGTTTAAT TGTTTGATTA AATGATTGAT TGGTTGGTTG 900
ATTGGCTGAT TGGTTGGTTG GTTCAAAATT GATTGATTGA TAGCTTGATT GATTGATTGA 960
TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTAGTTGATT AGTTGATTGG 1020
TTGGTTTACT GACTGATTGG TTGGTCGGTT GGCTGAAAAC ATGATTGATT GATTAACTGA 1080
TTGGTTTGGT TGGTTCATTG GCTGATTGGT TGGCTGAAAA ATTGATTGAC TGATTGATTG 1140
ATTTAATCAT TGTCTTAGTA ATGGGGAAGT TCTGAGCTCT GAGAGTTCTG TTTGTTTGCC 1200
CCCTCTATTT CTTTATATTT CTTTCAGTTA TTCAAATCAT TCCACACGTT GCCTTTTACA 1260
CAGGAATAGA AGTCGTGACT TTCGATACAA TAAAAAAAAA AGCACACAAA AAAAAACAGG 1320
GGACCTTTGG GCTCATTTTA GCATTCATTA AAACTACTCT ACCTCCAAAA TATTTTTAAC 1380
ACCAGTTCCT ATGAATAATA ATGATAATTA TTATACTGTA GGGATGATGA CAGTCAGAGG 1440
TGTGTTTGTG TGTTTTGAGA CAGACAGGAT GAGCGGGGGT CACCTGCTTT CAGTCTGGTG 1500
GAGTTAGTGT GTCTGTCGAA CCCAGGCGTG CTGTGGTGAT CTGACAGTAA TCCACAGCCA 1560
CTGCAGTGCG GAGTGTGTGT TACATTATCT GTCTTAATCC GCTAATCCGC GGACACACAG 1620
CTAATCTCAA TCCCACCCCC ACACACACCT TCCTCAGTAA TCACTCTAAT GATGGACCCC 1680
CGGCAACCGC CTTTCCACCC CTGACTGACA CACACACACG CACGCACACA CACACACACA 1740
CACACACACA CACACTCCTC CCAGGCA 1767