EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-15063 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr9:1176778-1178120 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr9:1177005-1177017TGCAGTGATTTG-7.22
HNF1AMA0046.2chr9:1177253-1177268TATTAATAATTAATT-6
Lhx3MA0135.1chr9:1177256-1177269TAATAATTAATTA-6.18
POU4F1MA0790.1chr9:1177254-1177268ATTAATAATTAATT+6.36
POU4F2MA0683.1chr9:1177254-1177270ATTAATAATTAATTAA+6.34
POU4F3MA0791.1chr9:1177254-1177270ATTAATAATTAATTAA+6.78
PRDM1MA0508.2chr9:1177195-1177205TCACTTTCAC+6.02
Enhancer Sequence
ACCCCAGATT AATTCACGTA GTTTACTATA AAACAACTAC ACAGTGATGT GCTATACATA 60
ATACTGTAGT ATTTCTATAA TACTCTTATA GCATTTACTA TAGTCATTTT CTTGTCTAAG 120
ATGCGGCAAA TGTAGTCCAC AAGATCTGAG CGTGCAGGAC ATTCAGAGGG AGCACATTCA 180
GAGTCTCACT GCATGGCAAC ACATGCTGTC AATTTCACAC TCTAATTTGC AGTGATTTGA 240
TTGGCCAGAA ACAGTGAGTG GGGGGAAACG AGGAGACACA CACCATCTAT CAACATCTCA 300
CACACACACA TCCACCTACA AGGAGACACA TGCAGACCTC AGCCGGAGCT ACAGCACACA 360
CACTTGTGGA GGAATTTATT TAGGGGTTTC TGTTGCAAAC ATGAATAATG GACACGGTCA 420
CTTTCACTGT TGGGTGTGAT TGGTTACAAA ATAACTGCAG ATACGAACTA TTTACTATTA 480
ATAATTAATT AAGTCACTGT CCCACACAAA CCCAAAGTAT TTAATGTCAT CGACTTACTA 540
ATAAAATAAA AATAACAGTA GATTAAAAAT AACAGTAGAT TAAAAATAAC AGTAGATCAC 600
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTATC 660
TTTGTGTGCG TACTGTACTC ATTGTGTAAT AGTTGGTCTC TGTGAGTGTG TGTGTGTTAT 720
TGTACTCATT GTGTAACATT AGGTCGCTGT GAGTGTGTGT GTGTTATTGT ACTCATTGTG 780
TAACAGTAGG TTGCTGTGAG TGTGTATGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTAT TGTACTCATT 840
GTGTAACAGT AGGTTGCTGT GAATGTGTGT GTGTGTGTTA GTGTACTCAT TGTGTAACAG 900
TATGTTGCTG TGAGTGTGTG TGNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 960
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1020
NNGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGA GAGAGAGAGT 1080
GTGTGTTACT CCGCTTGACT CTGCAGATGG CAGCATCTGA TCTCCGGTCA GTGTCTCCGT 1140
CTGCCGGTCT GCTGTCCCTC AGTATCTGCG GTTCTCCGTC ATTATAATCC CGTCTCTGAA 1200
GCCGGCGTCA TGGCGCCCGT GAGGAGGCTC CTCTGCTGCG CTTCTGCCCG CGACTGAAGC 1260
GGCTCCGGTG GCGGACACAC ACACGGCAGC ACCGCGGACA CGAGGACCGG ACACCGACCG 1320
CTGACTACCG GGTAAACGCC TG 1342