EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-15059 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr9:1080784-1082974 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr9:1081351-1081364TAAAACACTTAAA+6.33
ZNF24MA1124.1chr9:1082272-1082285CATTCATTCATTG+6.59
ZNF384MA1125.1chr9:1081019-1081031TCTAAAAAAAAA+6.52
ZSCAN4MA1155.1chr9:1081340-1081355CGCACACACTCTAAA+6.17
ZSCAN4MA1155.1chr9:1081298-1081313CACACACACTTAAAA+6.4
ZSCAN4MA1155.1chr9:1081994-1082009CACACACACTGAAAC+6.59
Enhancer Sequence
CTGTGTTTAA ATGGATGCAC AGATAAGGCA TGCTCTGCTT TTATATTTAG TACATACTGA 60
TCATTTTTGT TACTCTGAGT AGGCCGGAAT CAAAATTAAT CCCAGATTTT GCAACTATTT 120
TGGCTCCTCA ATCCAAAACA CTCTTTGAAA AACATTGCAG AGTTAGTGAA TGAATTACCT 180
GACGGCGTCC CGATCGCAGA TTTCAGCTCC TCTGAAGAGT TTCTGTGCTG GTTTCTCTAA 240
AAAAAAAGAG CTCTGCTGGG TGTTTCCCTG TTTTTGTCAC AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 300
GGAGAGAGAG AGAGAGAGAG GGAGAGAGAG AGAGAGAGAG ATGTGATGAA TGAAAAACAG 360
AAGTGAAGAC ATATGGACTG AGCCTGGACA CACACACACT AAAACACACT TAAATACATT 420
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACTAAAACA CCTAAATAGC GACAAACACA 480
CACACGCACT AAAACACACT TAAATACATT CACACACACA CACTTAAAAA CACTTATATC 540
AAAACAAACA CACACACGCA CACACTCTAA AACACTTAAA TAGCGACAAA CACACACGCA 600
CTAAAACACA CTTAAAAACA TTCTCACGCA AACACACACA CACACACACA CACACACTAA 660
AACACACTTA AATAGAGACA AACACACACA CAAACACACT AAAACACACT TAAATACATT 720
CACACACACT AAAACACACT TATATAGAGA CAAACACACA CACACACACA CACTTAAATA 780
CATTCACATA CACACACACT AAAACACACT TAAATACATT CACACACACA CACACACACA 840
CACACACTAA AACACACTTA AATACATTCA CACACACACA CACACACACT AAAACACACT 900
TAAATACATT CACACACATA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACTAAAA 960
CAAACACACA CACACATACA CTAAAACACA CTTAAATACA TTCACACACA CACACACACA 1020
CGCACGCACA CACACATACA CACACCAAAA CACACTTAAA TACATTCACA CACACACACA 1080
CACACACAAA CACACACACA CACATACTTA TATAGAGACA AACACACACA CACACACACA 1140
TACACTAAAA CACACTTAAA TACATTCACA CACACACACT AAAACACACG TATACAGAGA 1200
CAAACACACA CACACACACT GAAACACACT TAAATACATT CACACACACA CTCACACTTA 1260
AACGCACTTA TATAGAGACA AACACACACA CACTAAAACA CACTTAAATA CATTCAAGCA 1320
CACATACACA CACAAACTTA AACACACTTA TATAGAGACA CACACACACA CACACACACA 1380
CTAAAACACA CTTATATAGA GGCAAACCCA AACACAATAA AACACACTCA CAATGCATCC 1440
GGAAAGTATT CATAGCGCTT CACAAAACGT TCCAAACATT CCAAAAGTCA TTCATTCATT 1500
GTTTTACTGG CTTATCCCTT TAATAATTGC CACAGCAGAA TGAACCGCCA ACTTATCCAG 1560
CATATATATA CATATACATA TAAAATATAA ACGTATTAAC ACACACACAC ACAATAAAAC 1620
ATACTTACAC ACATATATAT ACACATTAAC ACAAACACAC ACAAACACAC ACACACACAC 1680
ACATACCATA AAGACCTAAT CCACTATATA CACACGGACA CACACACACA CACACACACA 1740
CACACACACA CACACAATAA AACATACTTA CACACATATA TATACACATT AACACAAACA 1800
CACACAAACA CACACACACA CACACATACC ATAAAGACCT AATCCACTAT ATACACACGG 1860
ACACACACAC ACACACACAT AGCTACACAT ACACACAATT TGTCCCTTCA TAAACTCCCT 1920
GCTGTGTGTT GTTTTGTTTG TGTGGTCAGA CATTTGCCAG CCGTCACACA GGTTTAATGA 1980
TTCAAACTCT TGTCACCACC TCACAAACCT CTCGCTCAAC AGTGTGTGTG TTTGTGTGTG 2040
TGTGTGTGTG TGTGCAGGAT CTTTCCGTGT GTGTCTCCAG AAAACTTTAT GGTCCAAATG 2100
AGAGATGTAT GATCTTTCTG TTTCTGGAAC TGTGATATGA TCACAAACGC GTCTGTAATT 2160
ATCATACAGC TCAAACAAAA CGGCTCTTAA 2190