EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-14928 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr8:44883843-44884904 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr8:44884601-44884618GCAATTAATTAATTACT+6.14
CTCFMA0139.1chr8:44884810-44884829TATCCAGTAGGTGGCGGAA+6.61
Foxd3MA0041.1chr8:44883916-44883928GAATGTTTATTT+6.74
Lhx3MA0135.1chr8:44884603-44884616AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr8:44884604-44884614ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:44884604-44884614ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
GTTATCCTTT TGAAAGTGAT ATATCCATGT TTAAGCTTTT TAATTTTTTC CCGGTGTAGC 60
CAGTAGGGAA GAGGAATGTT TATTTTAATG ATAATATTTG TGAATGAACT TCCCAAAACA 120
AAAAAAAACT ATTAATTTAT GTATTAAATG CCTACCGGGC ATAGGAACCT TATTTCGGCA 180
TTTGTTTAAG TGGGGCCGCA ATTAGTGTTG CACGCTTTGC TCTCCGGAGA GTTGCGTCAG 240
CCTCAGTTGG AGTCCAGACG CTGACGGGGA AAGACATGCA ATATGGGAGT AGTAGGTAAT 300
GAAGAGGCAG ACCAACTTGC AAAGGAAGCA TTACAACATA ATCAAATAGA AATAAAAATA 360
AGTCAGAGGT AAAAAGAAAA AAACATAATT GTAAAAGAAA CAGGTAGAAT GTGGCAAAGG 420
GAGTGGGATA ATGGAGAAAA AGGCAGACAT ATGCATAATA TTCAAGGATG TGTGGGTGGT 480
ACTAGAAATA AGTTTGGTAA TAGAAGGAAT GATGTGGTGA TAACTAGGTT GCGTGTTGGT 540
CATTGTTTGC TAAACCAGTA AAAGTTTAGA ATAGGGAAGC ATGAGACAGG ATGTTGTGAT 600
AAATGCGGGA AAATAGAAAC ATTAGAACAT GTAATTACAG AATGTGTGGC ATATGAAAAT 660
CAGAGATATC AATGAGTTCA AGGATTAAGC ATTTATGGGA TTAAAAATTT GTCATTTCAG 720
ACACTATTAG GAAACGGTTC AAATCAAGTT AAAATAATGC AATTAATTAA TTACTTAAAG 780
GAAACAAAAT TGATTAATAG AATTTAAGAA TAGCTTAGCA AAATAAGGAA TTAAAATTTG 840
ATATGGTATT TAACTAGTAT TTTTTTTCCT TTTTTTTTCT CCTCTCCTCC TACTCTTCTT 900
CCTGTTCTCT CTTCCCTTTG GTAATCTCAT CCCTCCATTC ATATCATATA TCTTTTGTAC 960
TCACTCCTAT CCAGTAGGTG GCGGAAATGC ACCATAAGTT GGTCTGCCAA CCGCCATTAA 1020
CCCCATAAGA AGAAGAAGAA GAAAGACATG CAAAAGTTTC T 1061