EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-14449 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr8:4163815-4165061 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr8:4163849-4163861GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr8:4164343-4164364ACTTACTTTTTGTTTCACTTA+6.08
Lhx3MA0135.1chr8:4165039-4165052TAATTAATTATCG+6.24
PBX2MA1113.1chr8:4164658-4164670ACTGTCAATCAT-6.07
PHOX2AMA0713.1chr8:4164272-4164283TAATTCAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr8:4164272-4164283TAATTCAATTA+6.14
SOX10MA0442.2chr8:4164236-4164247TTCTTTGTTTT-6.62
SP1MA0079.4chr8:4164700-4164715TAAGCCCCGCCCACA+6.97
SP2MA0516.2chr8:4164699-4164716TTAAGCCCCGCCCACAT+7.85
SP4MA0685.1chr8:4164700-4164717TAAGCCCCGCCCACATT+7.44
Enhancer Sequence
GCCTGCCAAT CTCCTCACTT GTGTCGGCCG GACTGTTTGT TTGTTTGTTC CGCTTGATTC 60
GTTTGCGAGT GCTGTTTTCT AGTTTTCTCC CTGTTTATGT TGATTTATCA ATTAAACTTG 120
TGCTGCTCTT GTTAATGTAT AGTGAGATTT TGAACGATCT TTATGAGAAT TGGATTACCT 180
GAGATCTTGT TTTGCTAATG GCTAACAGTG TGTACTTTAC GAGAATTCTA GCATTTCGAG 240
CAGCTTAGTA AAATTTTGTA TTAGTTAGTT TTTGGAGGCG TTGCCACATG TGTATTTATG 300
TTTGGGAGTT ATGAAGTTTA GTTAAGCTAC GTGCTGAAGA TTACGGTTTT GTTTCTGCAT 360
TTTTCTTTGT TCGGTCAGTT TAGTGGGTTG GGGTTTAGTT AGTTTGTTTT GTTATATTTA 420
TTTCTTTGTT TTGGCAACAC TCTTATTTTT CTTTATTTAA TTCAATTATT TAAAATTACA 480
TTTATCTTCC TTCTTACATT CATTGTTTGA CATTATCCAT TAATAAATAC TTACTTTTTG 540
TTTCACTTAT CAAGCGTATG TGTCTTCTCC TCATTCACCC AGCATCAATA GACTCACTGA 600
TTGTTACGTA TCATCCCTTT AATTATTTAA CATCATAAAC ACGTAACACA GTATTAGATA 660
TTGTCAAAAG TAATGCTGTT ACAGTAACGC AATACTAGTA ATGCAATATT GCCCAACACT 720
GATTATAGTT CACTCTAACA TACATCACAA TAAAAACCCA GACTTTAAGG CATCACAAAT 780
TTTAAATTAA AAGAGCAATA TTTCATAGCA ATATTAAAAC TTCTATTCTC AGATTGAGGC 840
TAAACTGTCA ATCATACAAG ATCCACCAAT CGCAAACCAC CTGATTAAGC CCCGCCCACA 900
TTAATTCACT AACATTCATC ACAACAACAC AGAAGACTTT AAATGCCTTT TGGAGCAGCC 960
TGTTCGACTG AGTCTTTTTA AAATAGTGTG TGTGAGACGC GCCCCGTACA CACACTCACT 1020
ACAGCAGAGC ATTAGGCCCT CATGACAATT AGCCTGGGAA AAGGTTTACG ACCGCCAGGC 1080
CCACAGGAGC GTACAAATCG GCACAGCCGG AGGCAGCCAG CAGAACAGGA AGGTAATTAC 1140
AGCTCTTCTC ATCATAACGC TGAGAGGAAG CAAGCGACAT AACGCACTCT TCCCCCCCGC 1200
GCAAGCTTCT CTTACATACT GCGGTAATTA ATTATCGTGC CTTTAC 1246