EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-14416 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr8:2129252-2131725 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU4F2MA0683.1chr8:2129546-2129562TTCATTAATTATGTTT-6.03
RFX1MA0509.2chr8:2129363-2129379CGTTATCATAGTAACT-6.28
RFX1MA0509.2chr8:2129363-2129379CGTTATCATAGTAACT+6.29
RFX2MA0600.2chr8:2129363-2129379CGTTATCATAGTAACT+6.09
RFX2MA0600.2chr8:2129363-2129379CGTTATCATAGTAACT-6.2
RFX3MA0798.1chr8:2129363-2129379CGTTATCATAGTAACT-6.06
RFX4MA0799.1chr8:2129363-2129379CGTTATCATAGTAACT-6.32
Enhancer Sequence
GAAAATTAAA AGTATTTTAA AATCTTAGGT GATGTTCATG TCTTAGTTAA TGCCTAATAA 60
CTAATTTGTT TCAATAAATG AGTTACTATA AAAATCAGTA TTTTAAACTA ACGTTATCAT 120
AGTAACTGAA TAAATCTGGT CATTTCTCAC TGTGATGCCT ATTATACTTT ATAATCTTTT 180
TTTCTTATAA CTGTTAAAAG TATCCTTTTG ATAATACAAC ATTCGCAATC ACTTTATCTT 240
TTTTTAAATC ATTTTTCTTT TTTTATTACA GAATTAAATC CATCTCCTTA TAGTTTCATT 300
AATTATGTTT ACCTATTGTG TTAACGAAGC ACAGTAAAAA ACTACTTTAC ATGGTTAAAA 360
ATCCTCTGCA TATAATTGAA ACTCTCTAAT TGTTAATAAG AACAAGTGTT TTTTCTTTAA 420
TTATACAACT AAAACAACCA TTATTACTAC TGAATCACGT TGTCGTCTTC ATCCATTTCA 480
ACACATCATG TAACACACCC AATATTTCTC TATTGCAAAC AACCTGTAAA GTCTTAAAAT 540
GATCTGATTG TTGATGTATC ATTTTATTTT CACAGCTCAA AGTACTATCG GGTACAGCAC 600
AAATCAAAAC AACACCACTT CAGCTGCACT GACCACTGAT ACTACAACTC CCACAACACC 660
ACCAGCACCG ACCACACTTT CAGCACCAAC TTCAGTGTCC TCAACAGAAA CAACTACAAC 720
TACAGCAACT ACAGCATCGT TTTCACCAGC TACAGCTACA ACATCATCAA CTACAGCATC 780
ATCTTCATCA GCACAAACTA CAACTACAAC AGAAACAACT ACATCATCTT CATCAGCACC 840
AACCACAACA CCAACAACTA CAACATCACC TACACCAACC ACAACTACAT CATCATCCTT 900
ACCAACCACA ACTACATCAT CATCCTTACC AACCACAACT ACAACATCAT CTACACCAAC 960
CACAACTACA ACACCAACAA CTACAATGTC ATCCACACCA ACTACAACAC AAACCACAAC 1020
ATCATCTACA CCAATCACAA CTACAACATC ATCCTTACCA ACCACAACAT CATCTACACC 1080
AATCACAACT ACAACATCAT CTACACCAAC CACAACATCA TCTACACCAA TCACAACTAC 1140
ATCATCTTTA CCAACCACAT CATCTACACC AATCACAACT CCAACAACTA CAATGTCATC 1200
TACACCAACT ACAACACAAA CTACAACATC ATCTACACCA ACCACAACTA CAACACCAAC 1260
AACTACAATG TCATCTACAC CAACTACAAC ACAAACTACA ACGTCATCTA CACCAACCAC 1320
AACTACAACA TCATCCTTAC CAACCACAAC ATCATCTACA CTTATCACAA CTACAACACC 1380
AACAACTACA ACGGCATCTA CACCAACCAC AACACCAACT ATAACAACTA CAACATCATC 1440
TTCATCAGCA CCAACCACAA CTTCAACATC ATCCTTACCA ACCACAACTA CAACATCATC 1500
TACACCAACC ACAACTACAA CATCATCTAC ACCAACCACA ACTACAACAT CATCCTCACC 1560
AACCACAACT ACAACATCAT CCTCACCAAC CACAACTACA ACATCATCCT CACCAAGCAC 1620
AACTACAACA CCAACAACTA CAACATCATC TACACCAACT ACAACACCAA CAACTACGTC 1680
ATCTACACCA ACCACAACTA CATCATCTAC ACCAACTACA ACTTCAACAC AAACAACTAC 1740
AACATCATCT TCACCAACCA CAACTACAAC ATCATCTACA CCAACCACAA CTACAACATC 1800
ATCTATACCA ACCACAACTA CAACTTCATC TTCACCAACC ACAACTGCAA CATCATCTTC 1860
ACCAACCACA ACTACATCAT CTTCACCAAG CACAACTACA ACACCAACAA CTACATCATC 1920
TACACCAACT ACAACACCAA CAACTACAAC GTCATCTACA CCAACCACAA CTACAACATC 1980
ATCTACACCA ACTACAACAC CAACAACTAC AACATCATCT ACACCAACCA CAACTACAGC 2040
ATCAACACCA ACAACTACAA CATCATCTTC ACCAGCATCA ACTACAACAT CAACTACAAC 2100
CCCCTCAACT ACAGCATCAT CTTCAACAGC ACAGTCTTCT GTCAGTCCAT CAACATGTAA 2160
GTCAACAACC TGAATATTTC AGTGAAACAT CTATTATATT GTAGTCAGGG GCAGACTGGG 2220
ACAGTATATT TGCCCGGGGC GGTTATCAGC CAGCTTTGAT CATAAGGAAA ACACATAACA 2280
AAAGTTTCCA TCTGGAGCTC CTTCACAGTC CAAAACACTT GCTCCAGGGC CGGCCTGTCA 2340
AACAGGGAAT ATGGGTGGTT GCCTTTCTTA GAGGGCCCTG CAATGGCTGC TTTTAAATAT 2400
ATAGTGTGAT CGTAAGCACA AGGATGAGCA TCTATGTATA TATCATAAAC AATGCTCACT 2460
GAGTAATGCA CAA 2473