EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-14394 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr8:897428-899844 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr8:899802-899819ATTAATTAATTAATTGA-6.13
ArxMA0874.1chr8:899803-899820TTAATTAATTAATTGAT-6.2
ArxMA0874.1chr8:899802-899819ATTAATTAATTAATTGA+6.73
HNF4GMA0484.1chr8:899574-899589TGACCTTTGACCTCC-6.53
Hmx3MA0898.1chr8:899806-899823ATTAATTAATTGATTGA-6.45
Lhx3MA0135.1chr8:899804-899817TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr8:899801-899814GATTAATTAATTA-7.34
NR2C2MA0504.1chr8:899574-899589TGACCTTTGACCTCC-7.95
Nr2f6MA0677.1chr8:899574-899588TGACCTTTGACCTC-8.42
PBX2MA1113.1chr8:899704-899716TTGATTGACAGA+6.11
PBX2MA1113.1chr8:899815-899827TTGATTGACAGA+6.11
POU4F2MA0683.1chr8:899771-899787TTGAATAATTGATTAA+6.35
POU4F3MA0791.1chr8:899771-899787TTGAATAATTGATTAA+6.38
POU6F1MA0628.1chr8:899802-899812ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:899806-899816ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:899802-899812ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr8:899806-899816ATTAATTAAT-6.02
RXRBMA0855.1chr8:899574-899588TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr8:899574-899588TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr8:899574-899588TGACCTTTGACCTC-8.12
Enhancer Sequence
TATCTAGTCT AATATTATGT GCTGTCATCA TGACAAAGAG AAAATAAATC AGTTATTAGA 60
GATGAGTTAT TAACACTATT ATGATTAGAA ATGTGTTAGA AACATTTAGG AGAGCTAACA 120
ATCCTGACTT CAGCAATATG TGGATGTAAA CACAGCTGTT GTAGTGTGTG ATACTGCAGT 180
GACGCACCTT GCATTTGTAG GGTTTGATGT CGGAGTGGAC GATCATGTGA GCCTTGAGCG 240
TCTGTTTCTG CACGAAGCTC TTGTAGCACA GCTCACACTG ATACGCGCGG ATGTTGGTGT 300
GGATCAGAAC GTGGCGCTTC ATGTTGGCCA GCAGTGTGAA CTCACGGCCA CAGATGCGAC 360
ACTTGTGCTC CTTCACTCCC TAACACAAAC ACACACACAC ATAGAGAGAG AGAGACATGA 420
GAAACCCACA CAAAATACAT ACATATATAA GAAACACACA CACACAAACG TACGCAAGAA 480
AACAAACATG AGACACACAG ACACACACAC ACACACACAT ATGAGAAACA CAAAAGGACA 540
GACAGACAGA CTCACACACA ACCACAAGAA ACACACACAG ACAGACACAC AAACAATAAA 600
CACACACACA CTCGTGAAAC AGACACACAC ACACATAAGA AATACACACA CACACACGAG 660
AAACGGACAC ACACACACAG ACAGACACAC AAACAATAAA CACACAGACA TTAGAAACAC 720
ACACACACAC ACTCGTGAAA CAGACACACA CACACAAGAA ACAGACACAC ACACACACAC 780
ACAAGAAACA CACACAGACA GACACACAAA CAATAAACAC ACAGACATGA GAAACACACA 840
CACACACTCG TGAAACAGAC ACACACACAC ATAAGAAATA CACACACACA CACACGAGAA 900
ACAGACGCAC ACAAACACAT AAGAAATACA CACACACACT CGTGAAACAG GCACACACAC 960
ACATAAGAAA TACACACACA CACACGAGAA ACAGACACAC ACACACACAT ATAAGAAATA 1020
CACACACACA CTCGTGAAAC AGGCACACAC ACACATAAGA AATACACACA CACACACGAG 1080
AAACAGACAC ACACACACAC ATAAGAAATA CACACACACA CTCGTGAAAC AGGCACACAC 1140
ACACATAAGA AATACACACA CACACACACG AGAAACAGAC ACAGACAGAC ACACAAACAA 1200
TAAACACACA GACATAACAA ACACACACAC ACACACACAC ACACATGAGA AACAGACACA 1260
CACACAAGAA ACACACAGAC AGACACACAA ACAATAAACA CACAGACATA ACAAACACAC 1320
ACACACACAC ACACACATGA GAAACAGACA CACACACAAG AAACACACAG ACAGACACAC 1380
AAACAATAAA AACACAGACA TGAGAAACAC ACACACACAC TCGTGAAACA GACACACACA 1440
CACATAAGAA ATGCACACAC ACACACAAGA AACACACACA GTCAGACACA CAAACAATAA 1500
ATACACAGAC ATGAGAAACA CACACACACA CACATAAGAA ATACACACAC ACACACACAC 1560
ACACTCGTGA AACAGACACA CACACACATA TAAGAAATAC ACACACACAC ACACGAGAAA 1620
CAGACGCGCA CACACACAAG AAACACACAC AGACAGACAC ACAAACAATA AACACACAGA 1680
CATATGAAAC ACACACACAC ACACACACAC ATGAGAAACA GACACACACA CAAGAAACAC 1740
ACAGACAGAC ACACAAACAA TAAACATACA GACATGAGAA ACACACACAC TCAAGAAAGA 1800
CACACACACA TTACAAACAC ACACACACAC ACACACACAC ACAAGAAACA AACACAGACA 1860
TTAGAAACAC ACACACGAGA AACACAAACA CACATAAAAA ACAGACAAAC ACACATGTGA 1920
AACACACAGA CCCAGAAACA AACACAAGAC ACACAGATAT GAAACACACA CACACACACA 1980
CACACACAAG AAAGAAACGC AGACATAAAT GAGAAACACA CACACGATCA TATGTAATGT 2040
CTGGCTGATG TTGTTTTGCA TCTGCTGATT TGTCTTCAAG ATGAAGCATC ACACAACCTC 2100
ATGTGTCCTC TGTGTGTTTT GACTAGACGT CCACCATACT GCTGCCTGAC CTTTGACCTC 2160
CACGACACAA CAAACCGAAA GTGTTTTCTC CGTACGTCTG GTAAGTCTAC ACTGCATTTC 2220
TGTCTCGTTC TCTAGTAGGA ATATCTGAAC TTTCTTAAGA CTGGTCGAAT AATTGATTGA 2280
TTGACAGATC AATTAATTGA CTGATTGATT AATTTACAGA CTGATGATTA ATTGACCTAC 2340
TGATTGAATA ATTGATTAAT TTACTGATTG ATTGATTAAT TAATTAATTG ATTGACAGAT 2400
CAATAAATTG ACTGAT 2416