EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-14373 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:73480897-73481711 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LHX2MA0700.1chr7:73481277-73481287GTTAATTAGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr7:73481232-73481245AAATAATTAATTA-6.71
Lhx3MA0135.1chr7:73481235-73481248TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr7:73481239-73481252TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr7:73481236-73481249AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr7:73481240-73481253AATTAATTAATTT-6.92
POU4F1MA0790.1chr7:73481230-73481244ATAAATAATTAATT+6.63
POU4F2MA0683.1chr7:73481230-73481246ATAAATAATTAATTAA+6.65
POU4F3MA0791.1chr7:73481230-73481246ATAAATAATTAATTAA+6.78
POU6F1MA0628.1chr7:73481237-73481247ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr7:73481241-73481251ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr7:73481237-73481247ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr7:73481241-73481251ATTAATTAAT-6.02
mix-aMA0621.1chr7:73481276-73481287AGTTAATTAGT+6.14
Enhancer Sequence
GCATAGAGGA CACTGTGATT CAGACAAGCT CTCATCCAGA CAGCGCTTGC AGAAGGTGTG 60
TCCACAGCTG ATGGAGACGG GTTCCTCAAG CAGGGTTTTG CAGACGGGAC AGAGAAGGTG 120
ACGAGAGACG TCTCCAACTG TAAGCATTGT GGATGTGTCA GATTAGAGTA GAGGGGACGG 180
CTGCAATGAC AATGCTAATT ATGAAATAAA ACATGCACAA AATCAGATGC TAAACAAGGG 240
TGCATCAGAA AATATGCCAT GAGATGATCT GTAAAGTATT ATTGCAATGA GCACTGGGAT 300
TGTCAGTCAG GCAGTCAGTC AAACAACCAA GATATAAATA ATTAATTAAT TAATTTGTTA 360
GATAGTTAGT TAGTTAGCTA GTTAATTAGT TAGTTAGTTA GTTAGTTAGT TAGTTAGTTA 420
GTTAGTTAGT TAGTTAGTTA GTTAGTTCGT TAGTTAGTTC GTTAGTTAGT TAGTTAGTTA 480
GTTAGTTAGT TAGTTAGTTA GTTAGTTAGT TAGTTCGTTC CATCCATCCA TCCATCCATC 540
CATCCATCCA TCCATCCAAC CATCCAACCA TCCAGTCAAC CAGCCAGTCA GCTAGCCAAC 600
CATCATTTCT CTCATAAAGC AGCTCTTATT ATATGATAGT CATGACTACA AATTATGGCA 660
AGAAGCATGC TGTATTAGAG TAATATATAT ATATATATAT ATATATAACA TCATCATCAT 720
AATCTTCATC ATCATTATTA TTATTATTAA TAATATTATT ATTAGTGTTA TTATTATTAG 780
TGTTATTATT AGAATTATAA TCATACTTTT TCCT 814