EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-14248 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:66348989-66350404 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr7:66350186-66350197TAATTTAATCA+6.62
DUXAMA0884.1chr7:66350185-66350198ATAATTTAATCAA+6.98
FOXC2MA0846.1chr7:66349212-66349224ATTGTTTATTTA-6.04
FOXD2MA0847.2chr7:66349213-66349226TTGTTTATTTAAG-6.29
FOXE1MA1487.1chr7:66349212-66349227ATTGTTTATTTAAGC-7.75
Foxq1MA0040.1chr7:66349211-66349222AATTGTTTATT+6.02
PBX1MA0070.1chr7:66349340-66349352CAATCAATCAAA+6.18
PBX1MA0070.1chr7:66350163-66350175CAATCAATCAAA+6.18
PBX1MA0070.1chr7:66349424-66349436CCATCAATCAAT+6.62
PBX1MA0070.1chr7:66349790-66349802CCATCAATCAAT+6.62
PBX1MA0070.1chr7:66349867-66349879CCATCAATCAAT+6.62
RREB1MA0073.1chr7:66349628-66349648CACCCACCCACCCACCTACC+6.55
Enhancer Sequence
AAAAAATATT GCACAAAGAT TGCTTTCAAA ACTAACATGT TATGACTAAC ACCTTGTTGC 60
CTTTGAGCCA TGGTTAAACT AGACCTTTGT CCTGTTGACT TCTATGCGAA TGCATGTAAT 120
GAAACTGCAA GCTTGTGTGA AAAGTTTTGC TACATTGATC TGCAAAAACT AATAAAAGTT 180
CAAAACAAGA CCTCTCTGTA TTAGAAATTG AAAACATAGA GGAATTGTTT ATTTAAGCAG 240
TGTCTTGTTT TATCCTGCTC AATCAATCAA TCAGTCCGTC AATCAGTCCG TCAATCAATC 300
AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC 360
AAACAGTCAG TCAATCAATC AATCAGTCAA AAAGTTAATC AATCAATCGA TTAATCAAAT 420
AACCAATGCA TCATTCCATC AATCAATCAA TACATCATTA TTCCCTCAAT CAATCAATCA 480
ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCCGTCC ATCTATCCAT CCATCCATTC 540
ATCCATCAAC CATTTTACTA TTCAATCAAT CAATCAATCA ATCCATCCAT CTATCCATCC 600
ACCCATCCAT CTATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ACCCACCCAC CCACCTACCC 660
ACCTACCCAC CAATCAATCA GTCCGTCCGT CCGTCCGTCC GTCCGTCCGT CCGTCCGTCC 720
GTCCGTCCGT CCGTCCGTCT GTCCGTCCAT CCATCCATCC ATCTATCTAT CTATCATTAT 780
TCCATGAATA AATCAATCAT TCCATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATAAA 840
TCAATCAATA AATCAAATCA AATAACCAAT ACATCATTCC ATCAATCAAT CAATCAATCA 900
ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA 960
TAATTAAATC AATCATTATT TAATTATATT ATTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC 1020
TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC 1080
TATCTATCTA TCCTTATTTC ATGATTAAAT CAATCATTCC ATCAATAAAT CAATCAACCA 1140
ATGCATCAAT TAATCAATCA ATAAATCAAT CAATCAATCA ATCAAATAAC CAATACATAA 1200
TTTAATCAAT CAATACATCA TTAATCAATC AATATTAAAT CAATCATTAT TTAATTATTA 1260
CAATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 1320
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCA TTCCATGAAT CAATCAATAT TCTATCAATA 1380
AATCAATCAA TCAATCGATC GATCAATCGA TCAAT 1415