EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-14142 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:53553219-53554299 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU2F2MA0507.1chr7:53553827-53553840TGCATTTGCATGT+6.37
POU2F2MA0507.1chr7:53554200-53554213ATATGCAAATAAA-6.98
POU5F1MA1115.1chr7:53554200-53554211ATATGCAAATA+6.02
RFX1MA0509.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.76
RFX1MA0509.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.77
RFX2MA0600.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.79
RFX2MA0600.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.92
RFX3MA0798.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.98
RFX3MA0798.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.99
RFX4MA0799.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.72
RFX4MA0799.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.88
RFX5MA0510.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.59
RFX5MA0510.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.85
Enhancer Sequence
TGAGAGCTTT TCTGAAAATG GCTTTGTTTG TCAGTGGGGG CTGCCAACAT TACCGCTACA 60
GCCCACCTTA GCGAGAGTGT ATCTGGCAGA CTACCAAGCT CCGCCTACGA ACGTTACCCA 120
CCTGTGTGAG CAAGGGGGGC GCAGCCTGTA GGTCATGGCG CACGTCTTTG TTCATTCATG 180
CCTCAAGGTT TTAAAACCAT TAAAACTATG CACTCTAAAT TTGGAAAATG CTGCATGAGG 240
TACTGATTTG TGCCCATTTG GAGCTAAGCC CTGGGTCTGC CGGAGGCAGG AGGCGATGGG 300
GGATGTAGTG TTAAGGGGTT AGGCAGAGGG GTCTCTCTGG GACCCAGCAC GCTCATTACT 360
GCGAGGAGTC CATCACTGAC AGCAGGTCAC CATGGTAACG GTTGGTATGT GATTCCCACA 420
ACAATGCCAA ACCTTCCCCC AACCTCCCTC ACCATTTTCC CCAATCAGCA CATGGAATTT 480
TCTCTCTCAT TCTCTCTCTG TCCATCTCTC CTCTCGCTGT CTTGCACTAT TACAGTATTG 540
TTGGCCAAGG ACAGAGCGAA GGTGTTTTTG ACAGCTTGTA TAGTGGTGGT GGTGTTGGTA 600
TGACTGCATG CATTTGCATG TATGGGTTGC ATGGAAGTGT TCACTGCAAA ACTACAGGGC 660
AGTAATTGTG TGTGTGTGCT AGATTGTTCC GGTATAATTG TGTAATGATG GATGGTGCTT 720
CTCTGGATTG AAGCCACGCC TGCCCTCATA AGGGAGCGCT CTGGAGACGG TTGTACGTTT 780
GAAGATGAAG AGAGATTGTG TTTATGTGTG TTGGGGGTTG TAGAGGTATG GGTTTGATCT 840
GCAACAGGGT AAACACTGGT TGGCCTGCTC TTGACTGGCA TTTTGTACTT TTTCCTGCTC 900
ATTAGAAAGC TGTAATGAAC GGCACTTTTA TAATATCATG CTTTTGATTT GATTTGGGAT 960
ATATTTTGGA GCACAAATAT GATATGCAAA TAAACTAATT TTACTGGTAA CCTAGAGTTA 1020
AACAATTGGG TTTTAACATT TTTATTCCCT CTAGCCCAAA CTCGGTCCTG GAGGTCTGGT 1080