EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-14103 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:50289622-50291111 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr7:50289850-50289860AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr7:50289850-50289860AGCAGCTGCT-6.02
NR2C2MA0504.1chr7:50290412-50290427AGGGGTTAAAGGTCG+6.03
NR2C2MA0504.1chr7:50290233-50290248CAGGTTCAGAGGTCA+6.11
NR2F1MA0017.2chr7:50290239-50290252CAGAGGTCAAAAG+6.59
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr7:50290241-50290256GAGGTCAAAAGTTCT+6.07
RXRBMA0855.1chr7:50290234-50290248AGGTTCAGAGGTCA+6.14
RXRBMA0855.1chr7:50290413-50290427GGGGTTAAAGGTCG+6.35
RXRGMA0856.1chr7:50290234-50290248AGGTTCAGAGGTCA+6.19
RXRGMA0856.1chr7:50290413-50290427GGGGTTAAAGGTCG+6.44
RarbMA0857.1chr7:50290240-50290256AGAGGTCAAAAGTTCT+6.59
RargMA0859.1chr7:50290241-50290257GAGGTCAAAAGTTCTT+6.43
RxraMA0512.2chr7:50290234-50290248AGGTTCAGAGGTCA+6.04
RxraMA0512.2chr7:50290413-50290427GGGGTTAAAGGTCG+6.44
Enhancer Sequence
TTCAACACAA AACCATCCCT GTTGCCATCC ACACATGCCG TGCAGATAAT TGATCTGTGC 60
TGAGCACTTC AATAGTAAGA GCAGTACCAC AAGACGCCTA ATGGTTTGCC TTTAAGCATT 120
TGCCATGTGC AGCAAAAAAA AAACTAGTGC ATAATGATAA CAGATTTCCT AATGCACCAG 180
TGATAATAAC AGTCTAATTA TACAAGATGC AGTAGGTATT TTAATACAAG CAGCTGCTCT 240
GTTGTGAGAA TGGAGCAAGG GGGTCCTAGC ACTGGATGCG GGATGCTGGA GGAGGCAGTT 300
TAACGAGCAC TTTCTCACCT GTGTGATTGG AGACAGAGAG GGCGACATTG TCGGCGAGAG 360
CTGTTTGCTC AGGCTTCTCC TCTGATCTCC CCCTGGAGAG AGCGTCAGGG GACTAATGGG 420
GGCCGGCCGC CTTCTGGGTG AACTCGCCAT GCCCGTTGGA GGAGGGTTGG ACATCGAGGA 480
GAGGCGCAGG GACGAGTGGA GTGAGGGGTT ACTGAGAGAC GAGTGCAGCT GAGAGTTGGT 540
GAGGGACGCT TGGATGGAAG GGTTGCTCAG TGAGGACGAC AGCCCTGAGG AGACAACAAA 600
CATGACATAA TCAGGTTCAG AGGTCAAAAG TTCTTCCTTA ATGAAACCGA GATAAACCAA 660
TAATGGCTTT ACGAGTCACC GCTCTCCTGT CCTGACATCC ACTCCTCAGA AAAGACACTG 720
AGCGATTGTC TGCAGGTTAC TGGAGCAGCG AGAGGCGCAG AGAAAAGAGC CGTTTATGAG 780
CAGCCAATTC AGGGGTTAAA GGTCGACTGT GTCTCTGAAT GGATCAGCCA ATGGATGAGC 840
GGCACAGCCC AAACGGGCAG CGAAAACATC CCAGCACACC CCGTTCCCAG ACATGGGAGC 900
GAATGGAAAG AATAAAGCTC AAGAGAATGC GAGTCAAAGA GAGCGATCAG ATGGCGGATG 960
GATTTTTAAA ACAAGGGGGG AAGAGAGAAA GAGAGCGAGA GAGAGAGAGC TGCGGTCTTC 1020
TGCATGGATG TGGTCCTTTA GAAAACACAT GGCATTCATT CGCCAGAAAG CGCCTACAGT 1080
GTAAGCCTAC AGTGTGCCGT TAAACAAAGA GCGAAGTGTT CAGCCAGGCC CGTCTGAAGC 1140
CAGGAGATGC TTTAACAGCA AACCAGTCTC CTTGAATAAC CATTTGGTCA CAAACAAAAA 1200
GCTCTTTTGA TCTTCAGACT GTGCGTGAAT TCGATTACGC ATGTGTGAAA AGCAGCGCGA 1260
GTATTTATGT GCCCGTTTAA TGCCGTGCAC CCGCTGACCT TGTGAGTTTC CGATGCCCAG 1320
ATGCATCATG GCCGCGGGCA GGTTGCCGGT GCTGCTGCCT CCGCTCAGAT TGGGATACCC 1380
AGCCTCGTCG GGGTCCAGCG GAGTGGGCAG AGGAGAGGGG AAGTGCAGGT TACTGAGGTC 1440
AGGAAGAGAC CCGCCAGTGT TTAACGTGCC CTGGTAGTGG GACAGACCC 1489