EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13777 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:28714358-28715576 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr7:28714817-28714829TAAATAAACAAA+6.18
Foxq1MA0040.1chr7:28715375-28715386AATAAACAATG-6.02
PBX1MA0070.1chr7:28715096-28715108ATTGATTGATGG-6.62
Enhancer Sequence
TATCTGAGTA TTGTTGCTGA CCATGTCCAT CCCTTTATAA CCACAGTGTA CTCTGATGGC 60
TACTTCCAGC AGGATAAGCC ATGTCAAAAA GCGTGAATCA TCTCAGACTG GTTTCTTGAA 120
CTTGAAGAGT TCTCTGTACT CAAACGGCCT CCACAGCCAC CAGAAATCAA TCCAATATAG 180
CACCTTTGGA ATGTGGTGGA ACGGGAGATT CACATCATAG ATGTGCAACC AACAACTACT 240
GTGTGATGCT ATCATGTCAA TATGGACCAA AATCTCTGAG GAATATTTCC AGTACCTTGT 300
TAAATCTATG CCACGAAGAA TTAAAGCAGT TGTGAAAGCA AAAGAGGGTC CAACCTGGTA 360
CTAACTAGTA AGTTATGCGT AATAAAGTGG CCGATGAGTG TAGAATCAGA CTTCATTATA 420
AGAGGCCTTT CTATAAAATG AAGCACACAG ATAAATAAAT AAATAAACAA AACATTTAAC 480
ATATGAACAC AAACCACCCT ATTGCTCTTT TCCGGTAATA TAAACAAAGG GGAATTAAAC 540
TACCCTAAAG ATAGAATTGT TGATACAGAA AATAACATGA AGAGAATGGG CTGATTGTAG 600
GTGACCTGTT CGTAAAAATG ACCTCAAACA GGAAAATTAG ATAAATAAAA ATAATAATAA 660
GGTAGCATTT CAACAAGCCA CCTTAATGTT TCTGATAACA TACAAACTTG ATTGATTGAT 720
TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT 780
GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATATTATT TTATATACCA AACCCTATTC ATATGTCTGA 840
ATGTAAAATT TTATCTTTAC ATGTGGAAAC TGGCTTGAAA GTAGTAGTAT AAATAAAATT 900
GATTATATGT GACCTATCCA TAAAATGACA CTAAAACCAG TTAAGAAGGG AAACCAGATG 960
ATTTGTATAA AAAATAATAA TGATGTGCTG TGTCTTATAG GAATGTTCTT TTACCGTAAT 1020
AAACAATGAT TCAGCTTCAC CTGCAAAGCC ATAAACTATT CTGTACATAT TGTTAACCAG 1080
TAAACATGTT ACCGCATATA TATTGCATTT TTTCTGTCAG AATTATAACT TTAAACAGTT 1140
TTCAGTCCTT TAAACAAACT TTTACCTTGA TCTTTCTCTC ACCGTTTTTC CTCTCAGAGC 1200
GTTTTAATGT GTTCCTGT 1218