EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13573 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:11653975-11656180 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr7:11655268-11655283GTTTAATCATTAATC-6.35
NR1H4MA1110.1chr7:11654633-11654644TCAATGACCTC+6.14
NR2F1MA0017.2chr7:11654177-11654190CCCATGACCTTTG-6.48
Nr2f6MA0677.1chr7:11654181-11654195TGACCTTTGAGCTC-6.6
PHOX2AMA0713.1chr7:11656040-11656051TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr7:11656040-11656051TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr7:11656040-11656051TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr7:11656040-11656051TAATTTAATTA+6.62
RXRBMA0855.1chr7:11654181-11654195TGACCTTTGAGCTC-6.27
RXRGMA0856.1chr7:11654181-11654195TGACCTTTGAGCTC-6.15
RarbMA0857.1chr7:11654173-11654189TGACCCCATGACCTTT-6.54
RxraMA0512.2chr7:11654181-11654195TGACCTTTGAGCTC-6.3
ZNF24MA1124.1chr7:11655069-11655082CATCCATTCATTC+6.44
ZNF24MA1124.1chr7:11655734-11655747CATTCATTCATCC+7.04
ZNF24MA1124.1chr7:11655730-11655743TATTCATTCATTC+7.52
Enhancer Sequence
GTTGGTTTTC ACGTCTTGTG TTTTAATAAA AAACATGCTT GTTGCAGATA TTACCAATAA 60
ATTAATCTCA ATTGAAGGTT CTTGAACTTT AATTCGTCTC TTCGCATAGT TTCACTCAGT 120
TGGTTGCCAT CATGTGATGG AATTTGGTGT CCATCCCTTG TCACTTTGTC ATTGTTGTGT 180
CTCCCGCCTT CCTTCTCATG ACCCCATGAC CTTTGAGCTC TTTCATGATG TCACGCCATA 240
GGACTCGCAG ACCTCTGACC TTAGGTCCTC AGTGCATGCG CTGGCGACCA GTGGGAACGC 300
AGGGTCTTCC ACACGCTCCC AAAATGCAGG AGAACTGGGG GAAGGGTGGG AGAAAACTGC 360
TAAGTATTGA TAGTCCTCAG TAACCGAGTC TGTTGAATAT CAAAACCCGC GACTCGCTCT 420
TTGTTCGGCC GACAAATGCA CTACAATTGA TTAGAAGCTG AATGCTAAGA GGAGCGTCAG 480
TCTCTCTTTT TTTCTTCCCA GGCCTTCGGA GTTCGCAGGG TCATGCCAAA AGGAGAGTCG 540
GTCAGTGAAT ACGCCGCGCT AAATTAATGG AGACCAGCCT GCGGTTCTTA ACATACTTAA 600
AGCAATATTG TGGGTTATTT TCGACTTAAT GTCTATAGCT GCCATCTGTG CATCACCGTC 660
AATGACCTCA AACAATAATT TCAGGCCATC TCTGCACTCT GTGAGTTAAA TGAGCTGCGT 720
TTACATAAAA CATCACAGTT TATAATAAAA CATAACCAAA TCATACTCTT TAAAGGGTGT 780
GGGATTGTTA AAATAATGAT TTAGGGATCA AATGAAGCAT TCCCATTCAA TTCAATAGCA 840
AATACACAAT AACTGATATT TTTCTCTTTT CATCCATCCA TACGTGACAA TACAGTACAT 900
TCATGCGTCT GTTTCATCTT TCCATCTTAA TATCTATCAT TCTGTCCATC CATCCATCTA 960
TCTGTCTAAT GTTCTATCTA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CGTCTAATCA 1020
TCCATCTATC CAACCATCCA ATGTTCCATA TCTCAATCAT TCCAGCCATC CATCTGTCTA 1080
ATATTTCATT CTTCCATCCA TTCATTCTTC TGTCTAATGT TCCCTCCATT TGTCCAATAT 1140
TCTATCCCTC ACTCCAACCG TCTTTTCATC CATCCATCAT CTGCTAGTGT TCTATTCATC 1200
CCTCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCTGTC 1260
TAATGTTCCA TCCATCCATT TATCCATCCA TCTGTTTAAT CATTAATCCA TCCAATACAA 1320
TGTGTCCTCC ATTCCTCCAA TGTTCTATCC CTCAATCCAA CCATCTGTTT CATCCATCAT 1380
CTGCTAATGT TTCATTCCTC GATCCGTTCA TTCATCTAAT GATTCATCTG TCCGCCCGTC 1440
CGTCCATCCA TTCATCCATC CGTCTAATGT CTGATTGCTT AACCCATCCA CCCATCCATC 1500
TGTCTAAAAT TTCATCCATC CATCCATCCA TCCATTTATC CGTCCGTCTA ATGTCCCATT 1560
CATCCATCCA ATGTTCCATC CCTCAATCCA TCCATCTGTC AAATGTTCCT TTTCTCCATC 1620
AATCATCAAT CTGCTGATGT TTCATCTGTC CATCCATCCT TCTAATGTTC CATCCATCCA 1680
TCTATCTATC TATCCATCCA TCCATCTATC TTAATATCTA TTATTCTGTC CATCCATCCA 1740
TTGTCTATGT CTGTTTATTC ATTCATTCAT CCTCACAGTC CATCCATCCA TCCATCCATC 1800
CATACATCCA TCTATCCAAC CATCCATCCA TCCATCCATC CATTCACCTA TTTATCCATC 1860
TCTGTCCATT CATTTGTTCA GCCACACAGG ACCATTCATG CCTATCTTTC CATCCGTCCA 1920
TCCACCCATC AATCCTTATA TTTCTATGAA TCCATGCTTA TCTTTCCATT CATCCATCCG 1980
TGAAAATCTT TAGGGATGGG TGATATTTTA TAATTTGCAA TATACTGGTA AATGTTTTGC 2040
CCAATAATAA TAAAAAATAA TAATTTAATT TAATTATTGT AATAACAATA AAACCTAAAA 2100
TGAATCTGTA AAATGATTTA CTATTGCAAG AATACAAGTG TGATATTTTT GTGTGTTTGA 2160
GCTTGTGTAC AAATACAGAT TGACTTAACT GAGTACCGAG ATGTA 2205