EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13539 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:8887173-8888253 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF9MA1107.1chr7:8887560-8887573ACCCACACCCACA+6.32
KLF9MA1107.1chr7:8887566-8887579ACCCACACCCACA+6.32
RREB1MA0073.1chr7:8887505-8887525CACCCACACACACCCACACC+6.06
RREB1MA0073.1chr7:8887473-8887493CCCCCCCACACACACCCACA+6.28
RREB1MA0073.1chr7:8887477-8887497CCCACACACACCCACACACA+6.39
RREB1MA0073.1chr7:8887507-8887527CCCACACACACCCACACCCC+6.6
RREB1MA0073.1chr7:8887523-8887543CCCCCACACACACACACACA+6.95
RREB1MA0073.1chr7:8887475-8887495CCCCCACACACACCCACACA+7.19
Enhancer Sequence
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNATGTA 60
TGTATGTATG TATGTATGTA TGTATATATA TGTATGTATG TACGTATATA TATGTATGTA 120
TGTATGTATA TATATGTATG TATGTGTATA TATATATATA TATATATATG TATATATATG 180
TACGTATGTA TATATATATT TATATATATA TATGTATGCA TGTATCTATA TATATGTCCG 240
AATGTGTGCA TATACCTATA TATCTACATA TATACCCACA TATACACATC TATATATACA 300
CCCCCCCACA CACACCCACA CACACATACA CACACCCACA CACACCCACA CCCCCACACA 360
CACACACACA CACACACCCA CACACACACC CACACCCACA CCCACACACA CACACACACA 420
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 480
CACACACACA CACACCCACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 540
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CCCACACACA CACCCACACA CACACACACC 600
CACACACACA CACACNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 660
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNGATTG 720
GCTGGAGAAC AGCAGGAAAT AAAAGTATTA TGTTTAAAAT AATTGAAATA TCACAGGAGC 780
TAATAAATGT GTGTATTGTT GTTGAACTCT TATATTTCTA TTATAGATAT TGATTCAAAG 840
GCACTCAAAG TAGTTAAATA GTGACTGACA TGTTCCTCTC TAAAATATTG GCCGCACATC 900
TTATACAATA CGTCTCATTT GTGAAGTGCT GTCTGTGAAA TATTCCTCTT AAGAATTGCA 960
GACGGATGTT TGAAAAAGAG TTTTGCATGC CAGATACGGA CAGATTAGCA CAATGAAAGA 1020
TGGTGCTTTA GGTCTTTTGG CTCGACAGTT TACTTTTTCC TTTTTTTTTT CCCCCTTCAC 1080